鱼类是脊椎动物中最原始而在种属数量上又最占优势的类群,其物种繁多,分布广泛,起源复杂,研究其遗传分化,阐明其进化途径,历来是令人饶有兴趣的课题.近年来,随着分子生物学技术向生物学各研究领域渗透,从分子水平,研究鱼类的遗传与进化,已越来越引人注目.在分子水平,研究鱼类的遗传与进化,选择合适的分子标记至关重要.鱼类线粒体DNA(mtDNA)与其他许多脊椎动物的mtDNA一样,是一种共价闭合、环状的双链DNA分子,具有mtDNA的共同特征:(1)分子结构简单;(2)严格的母系遗传;(3)几乎不发生重组;(4)进化速度快;(5)不同的区域进化速度存在差异,允许选择不同的区域进行不同时间尺度的进化分析.由于鱼类线粒体DNA具有上述特点,使其成为分子群体遗传学和分子系统学研究的重要标记.以mtDNA作为分子标记,探讨鱼类的群体遗传结构与系统演化,已成为鱼类群体遗传学和系统学研究中的热点.迄今,获得了许多有启发性的结果.