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A型肉毒神经毒素(BoNT/A)基因序列分析及其B细胞表位预测
  • 时间:0
  • 分类:Q939.93[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]军事医学科学院微生物流行病学研究所病原微生物与生物安全国家重点实验室,北京100071, [2]军事医学科学院药物毒物研究所新药设计中心,北京100850
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30370081)
中文摘要:

比较GenBank中4个不同毒株的A型肉毒神经毒素(BoNT/A)的基因组序列,发现其基因序列的一致性高迭92.2%-99.9%。基于保守性高的BoNT/A氨基酸序列,根据BioSun和LaserGene软件包中的表住分析相关参数,辅以对BoNT/A蛋白的二级结构的分析,综合预测BoNT/A的B细胞表位。结果表明,BoNT/A轻链的142-150、284-292区段,轻链的284-292,重链的440-450、465-480、538-549、699-710、751-760、1087-1095、1224-1231、1263-1270区段是B细胞表位优势区的可能性较大。多参数方案井结合不同软件综合预测BoNT/A蛋白的B细胞表位,为进一步实验鉴定BoNT/A的B细胞表位及其多表位疫苗设计和研究奠定了基础。

英文摘要:

Multiple sequences aligment analysis showed that the botulinum neurotoxin (BoNT) genes of the four different Clostridium botulinum type A strains share 92.2% - 99.9% identical nucleotide sequences.To predict B cell epitopes, based on highly conserved BoNT/A amino acids sequence. And combined with the prediction of the flexibility and the turn or the coil regions of the secondary structure of BoNT/A, the resuits showed that the B cell epitopes of BoNT/A were probably located at or adjacent to its N - terminal No.440 - 450,465 - 480,538 - 549, 699- 710,751- 760,1087- 1095,1224- 1231,1263- 1270 of the heavy chain of BoNT/A, and N- terminal No. 142- 150 of the light chain. 1253 - 1270 284 - 292 of the light chain. In a word,These datas obtained by the epitopes prediction using multiple parameters and the different analysis softwares are helpful for further epitope identification and design of multiepitopes - based vaccine of BoNT/A.

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