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尾叶桉GLU4中4-香豆酰辅酶A连接酶基因克隆及原核表达
  • ISSN号:1004-874X
  • 期刊名称:广东农业科学
  • 时间:2014.6.25
  • 页码:150-155
  • 分类:S792.39[农业科学—林木遗传育种;农业科学—林学]
  • 作者机构:[1]广西林科院广西优良用材林资源培育重点实验室广西南宁530002, [2]北京林业大学生物科学与技术学院,北京100083, [3]广西大学生命科学与技术学院,广西南宁530005
  • 相关基金:广西优良用材林资源培育重点实验室开放课题基金(12A0302);国家自然科学基金(31100473)
  • 相关项目:耐寒桉树生根活性物质鉴定及调控机制研究
中文摘要:

4-香豆酰辅酶A连接酶(4-coumarate:coenzyme A ligase,4CL)是木质素合成中的关键酶,根据植物中4CL保守序列设计引物,以尾叶桉GLU4嫩茎为材料克隆到其4CL基因,命名为Eu4CL.该基因gDNA长5 534 bp,cDNA长1 640 bp,CDS区编码544个氨基酸.Eu4CL核酸序列与GenBank已登录的桉属植物4CL基因同源性达到98%,与毛竹等其他科属植物4CL的同源性达77%以上,其编码的氨基酸序列经比对发现具有完整4CL结构域及AMP结合位点、CoA结合位点,与土肉桂等植物中4CL基因编码序列同源性也在79%以上,确定为4CL基因.对Eu4CL编码蛋白序列理化性质及结构进行生物信息学分析,利用MEGA软件对基因序列进行系统进化树分析.采用pQE30/M15系统对Eu4CL进行原核表达,重组质粒成功表达目的蛋白,分子量约60 ku.本研究从尾叶桉GLU4中克隆得到Eu4CL基因并原核表达,为该基因的酶学分析以及利用该基因转化调控尾叶桉木质素合成奠定基础.

英文摘要:

4-coumarate: coenzyme A ligase is a key enzyme in lignin synthesis pathway. A 4CL gene was cloned from the young stem of Eucalyptus urophylla clone GLU4 and named Eu4CL using specific primers based on the highly conserved sequences of plant 4CL. The gDNA and eDNA sequence were 5 534 bp and 1 640 bp respectively, while CDS encoded 544 amino acid residues. Eu4CL had 98% sequence homology with Eucalyptus that had been logged in GenBank, and its homology with Phyllostachys and others were over 77%. Eu4CL encoding sequence was analyzed, the result showed it has an entire 4CL domain, an AMP binding site and a CoA binding site, the homology with Cinnarnomum osmophloeum and others were over 79%. The physicochemical property, structure of Eu4CL and its phylogenetic analysis were analyzed using bioinformatics tools and MEGA. The SDS-PAGE analysis showed that Eu4CL was transfomled into pQE30/M15 system and fusion protein with molecular weight about 60 ku was successfully expressed in transformant. The cloning and prokaryotic expression of Eu4CL gene provided effective resources for enzymology research and futher research of transgenic.

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期刊信息
  • 《广东农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广东省农业科学院
  • 主办单位:广东省农业科学院 华南农业大学
  • 主编:
  • 地址:广州市天河区金颖路31号五山广东省农科院农经所
  • 邮编:510640
  • 邮箱:gdnykx@vip.163.com
  • 电话:020-38319948 38319941 38319942 38319946
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-874X
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1267/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 广东省第二、第三届优秀科技期刊,广东省首届十佳期刊,中国期刊方阵“双效”期刊,第四届全国农业优秀期刊一等奖,第五届全车优秀农业期刊鑫犁奖一等奖,首届全国CAD规范一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:33995