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黑线仓鼠MHCⅡ类DQA基因外显子2的克隆与序列分析
  • ISSN号:0253-9772
  • 期刊名称:《遗传》
  • 时间:0
  • 分类:Q951[生物学—动物学]
  • 作者机构:[1]曲阜师范大学生命科学学院,山东省曲阜市273165, [2]国家林业局森林病虫害防治总站,辽宁省沈阳市110034
  • 相关基金:国家973项目(2007CB109104);国家自然科学基金(30470247;30670335);曲阜师范大学“十一五”计划省级重点建设项目
中文摘要:

为了探明黑线仓鼠MHC的结构与功能并寻找分子标记,对MHCⅡ类DQA基因的外显子2进行克隆和序列分析.提取黑线仓鼠3个群体(吴村、沂南和临朐)的基因组DNA构建基因池,利用PCR技术扩增得到249bp的片段,将该目的片段连接到pMD18-T载体中,重组质粒转入大肠杆菌DH5α后利用蓝白斑法筛选阳性克隆,测序后得到该目的片段的核苷酸序列(Genbank登录号:FJ209306)并推导出氨基酸序列.结果表明:黑线仓鼠、人类、大鼠、小鼠、猪、马、牛、兔之间DQA基因外显子2的核苷酸序列同源性为68.7%-85%,氨基酸序列同源性为56.8%-83.5%,黑线仓鼠与大鼠、小鼠亲缘关系更近.测序得到的OQA基因外显子2的序列在物种间具有丰富的多态性,可以作为物种遗传分析的分子标记.

英文摘要:

In order to research the structure and ruction of MHC in Cricetulus Barabensis and look for a specific DNA marker, the genomic DNA is abstracted from three populations- Wucun, Yinan and Linqu, Shandong province, China. The 249 bp fragment of exon 2 of DQA gene is amplified successfully by PCR and cloned into pMD18- T vector, it the recombined carriers into E. coli DH5α after recombination. The positive clones are further identified by PCR. The nucleotide sequence of this fragment is acquired and the peptide sequence is deduced. The Genbank number for the former sequence is FJ209306. Homologies of nucleotide sequence and amino acid sequence of exon 2 among Cricetulus Barabensis, human, rat, mouse, pig, horse, cattle and rabbit are from 68.7% to 85% and from 56.8% to 83.5%, respectively. So Cricetulus Barabensis is more similar to rat and mouse. This fragment is very polymorphie and can be used as a molecular marker for genetic analysis among species.

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期刊信息
  • 《遗传》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国遗传学会
  • 主编:张永清
  • 地址:北京朝阳区北辰西路1号院中国科学院遗传发育所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:yczz@genetics.ac.cn
  • 电话:010-64807669
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-9772
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1913/R
  • 邮发代号:2-810
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,《CAJ-CD》执行优秀奖,2008年12月获“中国精品科技期刊”证书和北京市印...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
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