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利用回交重组自交系群体检测水稻苗期耐冷性基因座
  • ISSN号:1000-2030
  • 期刊名称:《南京农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S511.034[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/江苏省植物基因工程技术研究中心,江苏南京210095, [2]中国农业科学院作物科学研究所,北京100081
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30471120);国家科技攻关计划项目(2004BA525B02-04);江苏省自然科学创新人才基金项目(BK2003415)
中文摘要:

利用Nipponbare/Kasalath//Nipponbare回交重组自交系群体,对贮藏在低温(4℃)和室温条件下的种子进行低温发芽率的观察和统计分析,利用Windows QTL Cartographer 1.16软件,对控制水稻种子低温发芽力的QTL进行检测。结果发现,低温发芽力QTL分布于第1、5、6、8、9和12染色体上,其中位于第5染色体上的qLTG-5(C597-R3166)和第9染色体上的qLTG-9(R79-C385)在低温萌发过程中持续表达。qLTG-5只在常温贮藏条件下稳定表达,表明此位点可能受种子贮藏条件的影响;qLTG~9在两种贮藏条件下均稳定表达,表明该位点不受种子贮藏条件的影响,可能与种子的耐贮性有关。研究结果可为低温发芽力强的水稻品种的标记辅助选择和图位克隆奠定基础。

英文摘要:

To gain an understanding of the genetic control of seed germination rate under low temperature conditions ( LTG), 98 backcross inbred lines (BIL) derived from a cross between a japonica variety Nipponbare and an indica variety Kasalath were used, which seeds were stored at low temperature (4 ℃) condition or room temperature environment. Quantitative trait loci (QTL) controlling LTG was analyzed by the software of Windows QTL Cartographer 1.16. The results showed QTL for LTG located on chromosome 1, 5, 6, 8, 9 and 12. Two putative QTL, qLTG-5 ( C597 - R3166) and qLTG-9 ( R79 C385), were detected to express stability in the whole germinating time, In which qLTG-5 expressed stably only stored in room temperature so that it maybe associated with seeds storage environment. Correspondingly, qLTG-9 could express stably stored at two different environments so it suggested this QTL could not be affected by seeds storage environment and related to seeds storable. Now, the closely linked markers on chromosome 5 and 9 could be used to facilitate the development of new rice varieties with high LTG ability and long longevity in marker-assisted selection (MAS) and thus to develop NILs (near-isogenic lines) for map based cloning in the regions.

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期刊信息
  • 《南京农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:南京农业大学
  • 主编:郑小波
  • 地址:江苏省南京市卫岗1号
  • 邮编:210095
  • 邮箱:nauxb@njau.edu.cn
  • 电话:025-84395214
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2030
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1148/S
  • 邮发代号:28-53
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,全国优秀科技期刊,第二届江苏省十佳科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:22558