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蒙古冰草Afa家族串联重复序列克隆及染色体定位
  • ISSN号:1007-0435
  • 期刊名称:《草地学报》
  • 时间:0
  • 分类:S543.9[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]内蒙古农业大学生态环境学院,内蒙古呼和浩特010018, [2]草地资源教育部重点实验室,内蒙古呼和浩特010018, [3]中科院西北高原生物研究所,青海西宁810008
  • 相关基金:国家自然科学基金(31160479)(31260578);内蒙古草业重大专项“优质牧草种质资源创新与产业化示范”(20120245)资助 Acknowledgement This work was supported by National Nature Science Foundation of China (No. 31260578, No.31160479)
中文摘要:

Afa家族串联重复序列因只出现在小麦及小麦族近缘属物种而得名,本研究从蒙古冰草中克隆得到一个Afa家族序列,长度为233 bp,命名为pAmAfa1,该序列在GENBANK中进行同源序列比对,结果表明该序列与大多数小麦族其他物种的Afa家族串联重复序列存在较高的相似性;系统进化分析表明,蒙古冰草pAmAfa1序列与大赖草pLrAfa3,pLrAfa5序列聚在一起,表明蒙古冰草P染色体组与大赖草的N、X染色体亲源关系较近。为了明确Afa家族串联重复序列在蒙古冰草染色体上的位置,双色荧光原位杂交技术被采用,以pAmAfa1为探针检测到杂交信号出现在染色体的末端或近端部的区域,每条染色体上都有杂交信号,表明Afa家族串联重复序列普遍存在于P染色体组中。

英文摘要:

Tandem repetitive Afa-family sequences are known to occur in the wheat and related species of Triticeae. A member of the Afa-family sequences isolated from Mongolian Wheatgrass (Agropyron mongolicum Keng) (2n= 2x= 14,PP) is 233 bp, named as pAmAfal, which is most similar with other Afa-family sequences in Triticeae species. The phylogenic analysis results show that pAmAfal is clustered with pLrAfa3 and pLrAfa5, and the findings indicate that P genome has homology with N and X genomes. To know which the genome of Mongolian wheat- grass carries the Afa-family sequence; FISH is carried out using pAmAfal as the probe. The signals appear in the telomeric regions and subtelomeric regions of all chromosomes. This finding indicates that P genomes contain Afa-family repeats.

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期刊信息
  • 《草地学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国草原学会
  • 主编:王堃
  • 地址:北京市海淀区圆明园西路2号中国农业大学动科楼152室
  • 邮编:100193
  • 邮箱:cdxb@cau.edu.cn
  • 电话:010-62733894 62732799
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-0435
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3362/S
  • 邮发代号:80-135
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:13756