位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
珍稀铁皮石斛SSR标记的开发及种质纯度鉴定
  • ISSN号:0513-4870
  • 期刊名称:《药学学报》
  • 时间:0
  • 分类:R931.5[医药卫生—生药学;医药卫生—药学]
  • 作者机构:[1]南京师范大学生命科学学院,江苏南京210046
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30870234); 国家基础人才培养基金资助项目(J0730650); 江苏省自然科学基金资助项目(BK2008431)
中文摘要:

本研究利用磁珠富集法开发了60对铁皮石斛的SSR引物,从中筛选出15对多态性位点丰富、带型清晰、重复性好的引物。利用筛选出的SSR引物对铁皮石斛野生居群材料进行了遗传分析,共鉴定出等位变异92个,平均每个SSR位点等位变异数为6.1个;表观杂合度(HO)范围是0.60~0.85,平均值为0.72;期望杂合度(HE)范围是0.49~0.85,平均值为0.74。平均每个SSR位点多态信息含量(PIC)为0.702,变化范围为0.437~0.829。利用15对SSR引物对20种石斛试验材料进行跨种扩增,检测出有13对SSR引物具有种间通用性。此外,还利用所筛选的4对SSR引物检测了集约化种植过程中的铁皮石斛组培苗的种质纯度,结果显示:所开发的SSR标记可用于铁皮石斛组培苗的品种纯度鉴别。

英文摘要:

Simple sequence repeat (SSR) was used to investigate the genetic diversity and structure of Dendrobium officinale.A total of 15 primer pairs with stable and repeatable polymorphism were screened out from 60 SSR primer pairs developed by the method of microsatellite enrichment by magnetic beads.Forty-eight samples of Dendrobium officinale were analyzed in genetic polymorphism.These loci were polymorphic and displayed 3 to 9 alleles per locus with a mean number of 6.1.The observed and expected heterozygosities ranged from 0.60 to 0.85 and from 0.49 to 0.85 respectively.The polymorphic information content (PIC) of each SSR locus varied from 0.437 to 0.829 with an average of 0.702.Fifteen primer pairs were used in Dendrobium cross-species amplification and totally 13 primer pairs were proved to have the transferability in D.officinale related species.In addition,500 tissue culture plantlets of D.officinale were tested for purity identification by means of PCR amplification with four SSR primer pairs.The results showed that SSR technique is a feasible,simple and inexpensive method for determining adulterants in germplasm identification.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《药学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国药学会 中国药学科学院药物研究所
  • 主编:王晓良
  • 地址:北京市先农坛街1号
  • 邮编:100050
  • 邮箱:yxxb@imm.ac.cn
  • 电话:010-63026192
  • 国际标准刊号:ISSN:0513-4870
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2163/R
  • 邮发代号:2-233
  • 获奖情况:
  • 国家期刊奖,国家“双高”期刊,2002年为第2届国家期刊奖百种重点科技期刊并获第3...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国国际药学文摘,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:37721