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Molecular Identification and Expression Analysis of Tumor Necrosis Factor Receptor-associated Factor 2 in Grass Carp Ctenopharyngodon idella
  • ISSN号:1672-9145
  • 期刊名称:《生物化学与生物物理学报:英文版》
  • 时间:0
  • 分类:R730[医药卫生—肿瘤;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:[1]State Key Laboratory of Freshwater Ecology and Biotechnology, and Laboratory ofFish Immunology and Parasitology, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan 430072, China, [2]Graduate School of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100039, China
  • 相关基金:This work was supported by the grants from the National Natural Science Foundation of China (No. 30571412) and the Key Program of the Chinese Academy of Sciences (No. 2005192)
中文摘要:

肿瘤坏死因素联系受体的因素(TRAF2 ) 2 是一个关键部件几乎发信号的全部肿瘤坏死因素受体总科小径。在现在的学习, TRAF2 基因从草鲤鱼被克隆 { Ctenopharyngodon idella ) 由反向的抄写聚合酶,链反应和 cDNA 的快速的扩大结束。全身的 cDNA 是 3162 bp ,包括 60 bp 5' untranslated 区域( UTR ), 1611 bp 开的读框架,和 1491 bp 3' UTR.The polyadenylation 信号( AATAAA )和 mRNA 不稳定性主题( ATTTTA , ATTTA )被跟随由一 poly ,在3' UTR.No 信号肽或 transmembrane 区域的(A)尾巴在草鲤鱼 TRAF2 ( gcTRAF2 )的通常认为的氨基酸被发现了。种系发生的树分析清楚地证明 gcTRAF2 几乎金鱼的 TRAF2 基因。有它在从 56% ~ 97%.It 的另外的脊椎动物范围的相当或相同的事物的 gcTRAF2 的身份被一戒指类型签名在 N 终点,在中间的部分的一根锌手指,和由组成的一个保存 TRAF 领域描绘一 C 近似(TRAF-C ) 子域并且一 N 近似(TRAF-N ) 子域。在在脊椎动物的所有 TRAF2 相当或相同的事物之中的 TRAF-C 的身份从 78% ~ 97% 变化,而从 56% ~ 100%.The recombinant gcTRAF2 的 TRAF-N 范围的身份用 pET-32a 表示向量在 Escherichia 关口 i 被表示了。兔子 anti-gcTRAF2 polyclonal 抗体被获得。在不同机关的 gcTRAF2 的表示被即时量的聚合酶链反应和蛋白质印迹分析检验。它广泛地在心,头肾,胸腺,大脑,鳃,肝,怒气,和箱子肾被散布。这是在鱼的一个 TRAF2 相当或相同的事物分子的第一份报告。

英文摘要:

Tumor necrosis factor receptor-associated factor 2 (TRAF2) is a crucial component of almost the entire tumor necrosis factor receptor superfamily signaling pathway. In the present study, a TRAF2 gene has been cloned from grass carp (Ctenopharyngodon idella) by reverse transcription-polymerase chain reaction and rapid amplification of cDNA ends. The full-length cDNA is 3162 bp, including a 60 bp 5' untranslated region (UTR), a 1611 bp open reading frame, and a 1491 bp 3' UTR. The polyadenylation signal (AATAAA) and the mRNA instability motifs (ATTTTA, ATTTA) were followed by a poly(A) tail in the 3' UTR. No signal peptide or transmembrane region has been found in the putative amino acids of grass carp TRAF2 (gcTRAF2). Phylogenetic tree analysis clearly showed that gcTRAF2 is nearest to the TRAF2 gene of goldfish. The identity of gcTRAF2 with its homologs in other vertebrates ranges from 56% to 97%. It is characterized by one RING-type signature at the N-terminus, one zinc finger in the middle part, and one conserved TRAF domain consisting of a C-proximal (TRAF-C) subdomain and a N-proximal (TRAF-N) subdomain. The identity of TRAF-C among all TRAF2 homologs in vertebrates varies from 78% to 97%, whereas the identity of TRAF-N ranges from 56% to 100%. The recombinant gcTRAF2 has been expressed in Escherichia coli using pET-32a expression vector. The rabbit anti-gcTRAF2 polyclonal antibody was obtained. The expression of gcTRAF2 in different organs was examined by real-time quantitative polymerase chain reaction and Western blot analysis. It was widely distributed in heart, head kidney, thymus, brain, gill, liver, spleen, and trunk kidney. This is the first report of a TRAF2 homolog molecule in fish.

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期刊信息
  • 《生物化学与生物物理学报:英文版》
  • 北大核心期刊(2004版)
  • 主管单位:
  • 主办单位:中国科学院上海生物化学研究所
  • 主编:
  • 地址:上海岳阳路319号
  • 邮编:200031
  • 邮箱:abbs@sibs.ac.cn
  • 电话:021-54920956 54920955
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-9145
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1940/Q
  • 邮发代号:4-210
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:5851