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DNA条形码在主要滇产石斛鉴别中的应用
  • ISSN号:1007-8517
  • 期刊名称:《中国民族民间医药杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R197[医药卫生—卫生事业管理;医药卫生—公共卫生与预防医学]
  • 作者机构:云南中医学院,云南昆明650500
  • 相关基金:中药现代化科技产业基地建设(2014RE021).
中文摘要:

目的:选择云南境内应用面较广、市场流通量较大的14个石斛品种,建立其 DNA条形码鉴定方法。方法:结合Genbank数据库序列,选择ITS、psbA-trnH、matK、rbcL等4条常用序列对石斛DNA样品进行扩增和测序,利用MEGA5.0计算种间种内 K2P遗传距离并构建NJ树,同时采用Taxon DNA软件计算Barcoding gap (条形码种内种间遗传差异)。结果:ITS序列的K2P种内遗传距离小于种间遗传距离,NJ树可以很好地将不同品种的石斛分开,且有较明显的Barcoding gap。结论:ITS序列可以作为鉴别这14种滇产主要石斛的优选序列。

英文摘要:

Objective To identify 14 species of Dendrobium which widely used in Yunnan province by DNA barcoding.Methods Three chloroplast sequences including psbA-trnH,matK,rbcL and an ribosomal DNA ITS sequence of the 14 species were compara-tively analyzed.K2P distances were calculated and NJ Tree was performed applying MEGA 5. 0. Meanwhile,Barcoding gap were calcu-lated by Taxon DNA.Results The interspecific K2P distance of ITS were higher than the intraspecific one.And NJ tree could also di-vide species into different clades.The barcoding-gap were obvious between intra-and inter-species.Conclusions ITS sequence can be the optimal barcode to identify the 14 species of Dendrobium.

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期刊信息
  • 《中国民族民间医药杂志》
  • 主管单位:云南省科学技术协会
  • 主办单位:云南省民族民间医药研究会
  • 主编:郑进
  • 地址:昆明市关威远街166号龙园A座
  • 邮编:650201
  • 邮箱:zgyy1992@163.com
  • 电话:0871-65349183 5339255
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-8517
  • 国内统一刊号:ISSN:53-1102/R
  • 邮发代号:64-56
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 被引量:32488