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喜温嗜酸硫杆菌SM-1重金属抗性分子机制研究
  • ISSN号:1004-311X
  • 期刊名称:生物技术
  • 时间:2013
  • 页码:72-76
  • 分类:Q74[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]河南科技大学食品与生物工程学院,河南洛阳471023, [2]中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室,北京100101
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(“应用系统生物学手段揭示布氏嗜酸两面菌钼抗性分子机制”,No.31200035;“喜温嗜酸硫杆菌Acidithio-bacilluscaldus基因组不稳定性对其环境适应性的影响”,No.31171234)资助
  • 相关项目:应用系统生物学手段揭示布氏嗜酸两面菌钼抗性分子机制
中文摘要:

目的:/A基因组水平揭示冶金微生物喜温嗜酸硫杆菌SM-1的重金属抗性分子机制。方法:采用454GSFLX测序平台对SM-1进行基因组测序,利用NCBI非冗余蛋白数据库、Uniport蛋白数据库以及基因组百科全书数据库(KEGG)对全基因组序列进行功能注释,通过比较基因组分析参与重金属抗性的基因及可能的分子机制。结果:基因组中34个基因编码重金属抗性相关蛋白,其中29个基因参与砷酸盐、汞、镉、锌、钴等重金属抗性机制;38个基因参与维持细胞内适宜的蛋白质折叠环境,这将有助于SM-1适应高浓度重金属离子的生物冶金环境。结论:基因组学手段为全面揭示喜温嗜酸硫杆菌的重金属抗性分子机制提供了帮助,也为进一步通过遗传改造提升其重金属抗性、进而提高冶金效率提供理论指导。

英文摘要:

Objective:The genomic method was utilized to discover the molecular mechanisms of heavy metal resistance of Acidithiobacillus caldus SM - 1. Method: Genomic DNA of At. caldus SM - 1 was sequenced by the Roche 454 Genome Sequencer FLX instrument. Genefunction was annotated by homology searching in the NCBI NR( non -redundant), UniProt and KEGG protein database. Genes related to heavy metal resistance were identified by the comparative genomic analysis. Result :34 genes involved in heavy metal resistance were iden- tiffed in the genome of SM - 1,29 of which were responsible for the arsenic, fiaercury, cadmium, cobalt, zinc resistance. 38 genes were enco- ded to maintain an appropriate environment for protein folding, which will help for cell adaptation to the bioleaching environment. Conclusion: Genomics provides an novel strategy to unveil the genetic bases of AcidithiobaciUus caldus SM - 1 heavy metal resistance,which will further give insights to construct the engineered stains with better bioleaching performance.

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期刊信息
  • 《生物技术》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:黑龙江省科学院
  • 主办单位:黑龙江省科学院微生物研究所 黑龙江省微生物学会 黑龙江省生物工程学会
  • 主编:张介驰
  • 地址:哈尔滨市道里区兆麟街68号
  • 邮编:150010
  • 邮箱:swjszz@163.com
  • 电话:0451-84615121
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-311X
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1319/Q
  • 邮发代号:14-225
  • 获奖情况:
  • 中国生物学核心期刊,中国核心期刊(遴选)数据库...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:13503