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西湖底泥中厌氧氨氧化菌的分子生物学检测
  • ISSN号:0253-2468
  • 期刊名称:《环境科学学报》
  • 时间:0
  • 分类:X171[环境科学与工程—环境科学]
  • 作者机构:[1]浙江大学环境工程系,杭州310029
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(No.40801198); 浙江省自然科学基金项目(No.Y507227); 中央高校基本科研业务费专项资助项目(No.2009QNA6009)
中文摘要:

厌氧氨氧化(anaerobic ammonium oxidation,anammox)在海洋氮素循环中起了重要作用,而有关天然淡水生态系统中anammox的研究报道并不多.本研究采用16SrRNA基因克隆文库技术首次考察了西湖淡水底泥中anammox菌的分布与种群多样性水平.16SrRNA系统发育分析表明,西湖底泥中的anammox菌种群多样性水平较高,明显高于目前已报道的大部分自然生态系统,检测结果发现Brocadia,Kuenenia,Scalindua三个属的anammox菌共存于西湖底泥中.此外,本研究在西湖底泥中还发现了两个新的anammox菌序列群,其与目前已知anammox菌的序列相似度都较低(分别仅为92.9%~93.3%和91.6%~92.7%).与海洋底泥不同(海洋底泥中Scalindua属的anammox菌占主导地位),西湖淡水底泥中Kuenenia属的anammox菌明显占优.

英文摘要:

Anaerobic ammonium oxidation(anammox) plays a very important role in the marine nitrogen cycle.But reports on the distribution of anammox bacteria in natural freshwater ecosystems are few.We firstly investigated the distribution and diversity of anammox bacteria in the sediment of West Lake by constructing 16S rRNA gene colony libraries.Phylogenetic analysis of 16S rRNA genes showed that the sequences of Brocadia,Kuenenia and Scalindua could be simultaneously detected in the West Lake sediment,which showed a much higher diversity of anammox bacteria than most reported natural ecosystems.Furthermore,two new anammox bacterial clusters which only showed 92.9%~93.3% and 91.6%~92.7% sequence identity to described anammox bacteria were found in the West Lake sediments.The higher anammox bacterial diversity found in the sediment indicated a large variety of suitable ecological niches are provided for different anammox bacteria in West Lake freshwater ecosystems.As opposed to marine sediments where Scalindua bacteria dominated anammox guilds,Kuenenia organisms appeared to be the most common species in West Lake sediment.

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期刊信息
  • 《环境科学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院生态环境研究中心
  • 主编:汤鸿霄
  • 地址:北京2871信箱
  • 邮编:100085
  • 邮箱:hjkxxb@rcees.ac.cn
  • 电话:010-62941073
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-2468
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1843/X
  • 邮发代号:82-625
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰地学数据库,荷兰文摘与引文数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:56074