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中国汉族人群2型糖尿病30个候选基因相关性分析
  • ISSN号:1000-503X
  • 期刊名称:《中国医学科学院学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q71[生物学—分子生物学] R587.1[医药卫生—内分泌;医药卫生—临床医学;医药卫生—内科学]
  • 作者机构:[1]中国医学科学院,中国协和医科大学,基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室,北京100005, [2]Department of Endocrinology,PUMC Hospital,CAMS and PUMC,Beijing 100730
  • 相关基金:国家自然科学基金(30471930)
中文摘要:

目的 鉴定中国汉族人群2型糖尿病易感基因.方法 对30个候选基因进行单核苷酸多态性(SNP)的发现、基因分型,并进行单倍型构建.对群体资料的SNP和单倍型数据进行病例-对照研究,并在77个trio家系中进行传递不平衡检验(TDT).应用报告基因法对1个阳性SNP位点rs5210的基因表达调控作用进行分析.结果 KCNJ11基因的几个SNP位点与中国汉族人群2型糖尿病相关,其中rs5219的等位基因频率,rs5210、rs2285676和rs5219的基因型频率,以及由rs5219和rs5215构成的单倍型GA的频率,在病例组和对照组间差异具有显著性(P<0.05),单倍型GA的TDT检验也具有统计学差异(P<0.05).报告基因分析显示rs5210两个等位基因的基因表达调控作用差异具有显著性(P<0.05).结论 KCNJ11基因是中国汉族人群2型糖尿病易感基因之一.

英文摘要:

Objective To identify the susceptibility genes of type 2 diabetes in Chinese Han population. Methods Single nucleotide polymorphism (SNP) discovery, genotyping and haplotype construction were performed in 30 candidate genes. Case-control study were carried out in a population-based sample and confirmed by the transmission disequilibrium test (TDT) analysis in 77 trio pedigrees. The effects of the SNP rs5210 on gene expression were studied by reporter gene technique. Results The case-control studies showed that several SNPs on KCNJ11 gene was associated with type 2 diabetes in Chinese Han population, in which the allele frequency of SNP rs5219, the genotype frequency of rs5210, rs2285676 and rs5219, and the frequency of haplotype GA combined of the rs5219 and rs5215 showed significant difference between these two groups ( P 〈 0. 05 ). In addition, TDT test also showed statistical significance on this haplotype GA ( P 〈 0. 05 ). The reporter gene assay showed that the effect on gene expression was significantly different between two alleles of rs5210 (P 〈 0. 05 ). Conclusion KCNJ11 gene is one of the susceptibility genes of type 2 diabetes in Chinese Han population.

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期刊信息
  • 《中国医学科学院学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国卫生部
  • 主办单位:中国医学科学院 中国协和医科大学
  • 主编:曹雪涛
  • 地址:北京东单三条九号
  • 邮编:100730
  • 邮箱:actacams@263.net.cn
  • 电话:010-65105898 65237951
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-503X
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2237/R
  • 邮发代号:2-365
  • 获奖情况:
  • 1992年第一届全国优秀科技期刊三等奖,1996年第二届全国优秀科技期刊二等奖,2001年中国期刊方阵双百期刊,2004年卫生部首届医药卫生优秀期刊一等奖,第三届国家期刊奖百种重点期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国生物医学检索系统,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:19752