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LRP16结合poly(ADP-ribose)关键位点的识别
  • ISSN号:1007-7626
  • 期刊名称:中国生物化学与分子生物学报
  • 时间:2013
  • 页码:1048-1053
  • 分类:Q71[生物学—分子生物学] Q522[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]解放军总医院基础医学研究所分子生物学研究室,北京100853
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(No.31270820,81230061),北京市科技新星计划(No.2011113)
  • 相关项目:长链非编码RNA HOTAIR参与调控t(8;21)+白血病细胞的分化及其机制研究
中文摘要:

LRPl6作为macro domain家族成员,可识别、结合poly(ADP—ribose),参与DNA损伤修复的早期反应.但究竞LRPl6通过其何种氨基酸位点识别、结合poly(ADP—ribose)(PAR)尚不十分清楚.本研究首先通过对LRPl6蛋白的结构分析,查找LRPl6结合PAR的候选氨基酸位点,然后利用丙氨酸扫描技术构建系列LRPl6(点)突变体,并且进行原核蛋白表达与纯化,将获得的蛋白质进行斑点杂交实验,检测LRPl6突变体蛋白与PAR的结合活性.测序结果显示,LRPl6点突变基因序列成功插入到原核表达载体pGEX-6p-1中;斑点杂交实验显示,LRP16中第160位D和第161位I突变成A后,其与PAR结合能力明显减弱,而第181位G、183位V、184位D同时突变为A,LRP16与PAR的结合活性有部分减弱.结果表明,LRP16中第160位和第161位的氨基酸是其与PAR结合的关键位点.

英文摘要:

LRP16 is a member of macro domain protein family. It recognizes and binds poly (ADP- ribose) and is involved in the early response of DNA damage. The key amino acids to interact with poly (ADP-ribose) (PAR) remained unclear. In this study, wild type and mutants by alanine scanning of LRP16 were constructed to identify the PAR-binding sites. Prokaryotic vecter pGEX-6p-1 was used for expression. The produced mutant proteins were purified, and subjected to PAR binding assay in vitro. The dot blot results suggested that the PAR binding activity dramatically reduced when D160 and I161 of LRP16 were mutated; partial attenuation was observed when 181G ,183V and 184 D substituted with A. The findings suggested that D160 and I161 of LRP16 were the key sites for PAR binding.

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期刊信息
  • 《中国生物化学与分子生物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国生物化学与分子生物学会 北京大学
  • 主编:周春燕
  • 地址:北京市学院路38号北京大学医学部
  • 邮编:100083
  • 邮箱:shxb@bjmu.edu.cn
  • 电话:010-82801416
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-7626
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3870/Q
  • 邮发代号:82-312
  • 获奖情况:
  • 被美国《CA》列入世界引用频次最高的《千种表》
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:9731