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利用主成分分析和分层聚类分析法研究氟诺喹酮类药物分子结构活性关系
  • ISSN号:1674-0068
  • 期刊名称:《化学物理学报》
  • 时间:0
  • 分类:F279.246[经济管理—企业管理;经济管理—国民经济] TQ460.1[化学工程—制药化工]
  • 作者机构:[1]四川大学原子与分子物理研究所,成都610065, [2]河南师范大学物理与信息工程学院,新乡453002
  • 相关基金:This work was supported by National Nature Science Foundation of China and China Academy of Engineering Physics (No. 10376021) and Provincial National Science Foundation of He'nan (No. 2004601107).
中文摘要:

用密度泛函理论计算了12种具有抗肺炎链球菌的氟诺喹酮类药物分子的分子特性.利用主成分分析和分层聚类分析方法来简化氟诺喹酮类药物数据库的维数.主成分分析法表明,变量ELUMO、Q3、Q5、QA、lgP、MR、VOL、△EHL能够有效地对抗肺炎链球菌的氟诺喹酮类药物进行分类.分层聚类方法的结果和主成分分析方法的结果一致.这表明两种方法都能够对新的具有抗肺炎链球菌的氟诺喹酮类药物的分类提供一个可信的规律.利用主成分分析法和分层聚类分析法对其他6个氟诺喹酮类药物分子进行分析,结果都表明有两个药物分子具有较强的抗肺炎链球菌活性,此结果和临床结果相吻合.

英文摘要:

Density functional theory (DFT) was used to calculate molecular descriptors (properties) for 12 fluoro-quinolone with anti-S.pneumoniae activity. Principal component analysis (PCA) and hierarchical cluster analysis (HCA) were employed to reduce dimensionality and investigate in which variables should be more effective for classifying fluoroquinolones according to their degree of an-S.pneumoniae activity. The PCA results showed that the variables ELUMO, Q3, Q5, QA, logP, MR, VOL and △EHL of these compounds were responsible for the anti-S.pneumoniae activity. The HCA results were similar to those obtained with PCA.The methodologies of PCA and HCA provide a reliable rule for classifying new fluoroquinolones with antiS.pneumoniae activity. By using the chemometric results, 6 synthetic compounds were analyzed through the PCA and HCA and two of them are proposed as active molecules with anti-S.pneumoniae, which is consistent with the results of clinic experiments.

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期刊信息
  • 《化学物理学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国物理学会
  • 主编:杨学明
  • 地址:合肥中国科学技术大学
  • 邮编:230026
  • 邮箱:cjcp@ustc.edu.cn
  • 电话:0551-3601122
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-0068
  • 国内统一刊号:ISSN:34-1295/O6
  • 邮发代号:26-62
  • 获奖情况:
  • 1998年获安徽省优秀科技期刊一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国科学引文索引(扩展库),英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:4282