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基于组合策略的慢性阻塞性肺疾病的差异表达基因的筛选
  • ISSN号:1674-1633
  • 期刊名称:《中国医疗设备》
  • 分类:R563.9[医药卫生—呼吸系统;医药卫生—临床医学;医药卫生—内科学]
  • 作者机构:[1]首都医科大学生物医学工程学院,北京100069, [2]首都医科大学临床生物力学应用基础研究北京市重点实验室,北京100069, [3]首都医科大学附属北京朝阳医院呼吸医学中心,北京100020
  • 相关基金:北京市自然科学基金项目(7142015);北京市教育委员会科技计划面上项目(SQKM201210025008);北京市优秀人才培养资助项目(2012D005018000002);国家自然科学基金项目(31100905);首都医科大学基础临床-合作项目(11JL30,11JL33,12JL75)。
中文摘要:

目的:应用组合策略筛选慢性阻塞性肺疾病(COPD)的差异表达基因。方法采用芯片显著性分析算法(SAM)从GEO数据库中提取COPD差异表达基因,并通过5种基因排序算法对基因进行筛选,并对筛选后的COPD相关基因进行随机扰动分析和GO功能富集分析。结果发现GON4L和P4HB是重要的COPD相关基因。结论组合策略提高了COPD易感基因识别的准确率。

英文摘要:

Objective To screen differentially expressed genes of chronic obstructive pulmonary disease (COPD) through combined strategy.Methods Significance analysis of microarrays (SAM) was used to extract the differentially expressed genes of COPD from GEO database, which then were screened through five kinds of genetic sort algorithms. Then stochastic disturbance analysis and function enrichment analysis of the screened genes were conducted.Results GON4L and P4HB were important genes related to COPD.Conclusion The recognition accuracy of susceptibility genes of COPD has been improved with the application of combined strategy.

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期刊信息
  • 《中国医疗设备》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中国整形美容协会
  • 主编:姜远海
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  • 邮编:101312
  • 邮箱:submission@cmdmedia.cn
  • 电话:010-57065632
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-1633
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5655/R
  • 邮发代号:82-555
  • 获奖情况:
  • 中华医学会医学工程学分会会刊、中国医师协会临床...
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊
  • 被引量:14160