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部分香蕉品种SSR指纹图谱的构建
  • ISSN号:1009-9980
  • 期刊名称:《果树学报》
  • 时间:0
  • 分类:S668.1[农业科学—果树学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]海南大学农学院,海口570228, [2]中国热带农业科学院热带作物生物技术研究所、农业部热带作物生物技术重点开放实验室,海口571101, [3]中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南儋州571737, [4]广东省农业科学院果树研究所,广州510640, [5]琼州学院,海南三亚572002
  • 相关基金:国家自然科学基金(No.30460070);科技部科技基础条件平台(2005DKA21000);海南省高校研究生创新科研课题(Hxwby2008-11)
中文摘要:

采用SSR标记技术构建香蕉品种的分子指纹图谱,为香蕉品种鉴定提供依据。以56份香蕉种质为材料,从199对引物中筛选出5对多态性及稳定性较高的SSR引物进行PCR扩增。5对引物在56个品种中扩增出的多态性带数在11-16个,平均为13.8条;引物的多态信息含量(PIC)在0.8490~0.9022,平均0.8727。依据香蕉SSR带型特征,对每个引物生成的不同带型直接编号,简化香蕉SSR带型记录方法,并利用每个品种的带型编号,建立其DNA分子指纹图谱,5对引物可将56份供试香蕉材料完全区分开。表明SSR标记技术可用以鉴定香蕉种质。

英文摘要:

A total of 56 banana accessions were investigated in this study. Five pre-selected primers from 199 showed ample polymorphism and could distinguish all the materials studied. The number of polymorphic bands varied between 11 and 16 among the 56 accessions with an average of 13,8. The mean of polymorphism information content (PIC)value was 0.80, ranging from 0.45 to 0.91. Due to the complex SSR patterns in banana,it was difficult to score each band with number 1 and 0. Here, we scored each SSR pattern with an alphanumeric code instead of with pairs of 1 and 0. By arranging all of pattern numbers, we can build the fingerprint code for every banana accession.

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期刊信息
  • 《果树学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:农业部
  • 主办单位:中国农业科学院郑州果树研究所
  • 主编:王志强
  • 地址:河南省郑州市航海东路南中国农业科学院郑州果树研究所
  • 邮编:450009
  • 邮箱:chinagsxb@163.con
  • 电话:0371-65330928 653387308
  • 国际标准刊号:ISSN:1009-9980
  • 国内统一刊号:ISSN:41-1308/S
  • 邮发代号:36-93
  • 获奖情况:
  • 获河南省优秀期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:18699