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用5' LongSAGE标签分析蜜蜂Yps基因转录起始位点的多样性
  • ISSN号:1009-8224
  • 期刊名称:《泉州师范学院学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q946[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]泉州师范学院分子生物学与药物化学实验室,福建泉州362000
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30300183);福建省教育厅省属高校项目(2008F5051)
中文摘要:

使用5' LongSAGE标签序列确定了一个新的西方蜜蜂Ypsilon Schachtel(Yps)基因的转录起始位点,并进而预测了该基因的启动子序列.5' LongSAGE标签的蜜蜂基因组定位结果表明:在成年雄蜂的头部中,蜜蜂Yps基因存在23个转录起始位点,其中优势转录起始位点有4个,其起始频率分别为27.9%、23.1%、13.5%和11.5%.Yps基因TSS的碱基组成分析发现,此23个TSS第一个碱基为A、G、T、C的概率分别为52%、39%、4%、4%.这些结果暗示RNA聚合酶和调控因子在Yps基因启动子的一个较宽范围内的互作控制着不同转录本的起始效率.

英文摘要:

In this investigation, we determined the transcription initiation start site (TSSs) of a novel honeybee Ypsilon Schachtel(Yps)Yps gene by mapping 5' LongSAGE tag sequences to genome sequence of Apis rnellifera. We also analyzed the gene structure as well as promoter sequences of Yps gene. A total of 23 5' LongSAGE tags were mapped to upstream of Yps gene start condon, indicating Yps gene can initiate transcription at 23 different sites. Noticeably, there were 75% of bee Yps mRNA were started at 4 dominant TSS (27.9% ,23.1%,13.5% and 11.5%) in adult drone head. The results imply that the interplay between polymerases and regulators over broad promoter region dictates the efficiency of productive transcription for the bee Yps gene. This is the first report about divergent TSSs for bee genes.

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期刊信息
  • 《泉州师范学院学报》
  • 主管单位:福建省教育厅
  • 主办单位:泉州师范学院
  • 主编:林华东
  • 地址:福建省泉州市东海大街398号
  • 邮编:362000
  • 邮箱:
  • 电话:0595-22919659
  • 国际标准刊号:ISSN:1009-8224
  • 国内统一刊号:ISSN:35-1244/G4
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 1999年,获省高校自然科学学报系统优秀学报评比一等奖,2000年,获全国高校自然科学学报“三优”评比二等奖,2000年,获《CAJ-CD规范》执行优秀奖,2006年,获“全国优秀社科学报”称号,2006年,获首届中国高校特色科技期刊奖,2006年,获“首届福建省高校特色学报”称号,2007年,获全国地方高校优秀学报一等奖,2010年,获“全国优秀社科学报”称号,2010年,获“全国高等师范院校十佳学报”一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 中国国家哲学社会科学学术期刊数据库
  • 被引量:3724