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先天性视网膜脉络膜缺损一家系基因连锁定位分析
  • ISSN号:1003-9406
  • 期刊名称:《中华医学遗传学杂志》
  • 分类:R774.12[医药卫生—眼科;医药卫生—临床医学] R587.1[医药卫生—内分泌;医药卫生—临床医学;医药卫生—内科学]
  • 作者机构:[1]北京大学医学部基础医学院病生研究室,100191, [2]北京大学第三医院/北京大学眼科中心
  • 相关基金:国家自然科学基金(30470975)
中文摘要:

目的对一个连续3代常染色体显性遗传性先天性视网膜脉络膜缺损(autosomal dominant congenital retinaochoroidal coloboma)家系进行致病基因的连锁定位分析。方法对家系所有成员进行详细的临床检查,排除其他系统疾患。提取家系成员外周血DNA,选取位于全部染色体上的398对微卫星标记物,进行全基因组扫描。经ABI3130型遗传分析仪,Genescan收集数据,Genotyper进行基因分型,Linkage软件计算两点Lod值。结果在2号染色体长臂上的微卫星标记物D2S2382取得最大的Lod值,其Lod值为3.01。进一步在D2S2382附近选择微卫星标记物,进行连锁分析,发现微卫星标记物D2S2382-D2S301D2S2244-D2S163与家系中所有患者疾病表型共分离。结论将一个常染色体显性遗传性先天性视网膜脉络膜缺损家系的致病基因定位于2q34—2q35之间的3.80cM范围内。

英文摘要:

Objective To map the candidate gene by linkage analysis in a Chinese family with autosomal dominant congenital retinaochoroidal coloboma. Methods A detailed clinical examination was performed for all patients in the family. The genomic DNA of all family members was extracted from peripheral blood leukocytes. Linkage analysis and genome-wide linkage screening was conducted using fluorescent detection of 398 microsatellite markers representing all autosomes at an average resolution of approximately 10 cM. Polymerase chain reaction was carried out to amplify all 398 microsatellite markers. The allele sizes were determined on ABI 3130 Avant genetic analyzer according to an internal size standard, and the results were analyzed using Genescan 3. 1 and Genotyper 2.0 software. Results Linkage analysis showed the markers D2S2382 D2S301-D2S2244 D2S163 co segregated with the disease locus in all affected members. The maximum Lod score was 3.01(D2S2382). Conclusion The candidate region of the disease gene in the family was located in 2q34-2q35.

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期刊信息
  • 《中华医学遗传学杂志》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中华医学会
  • 主编:
  • 地址:成都市人民南路3段17号
  • 邮编:610041
  • 邮箱:cjmg@cma.org.cn
  • 电话:028-85501165
  • 国际标准刊号:ISSN:1003-9406
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1374/R
  • 邮发代号:62-163
  • 获奖情况:
  • 2000年获四川省优秀期刊一等奖,1997年获中国科协优秀期刊二等奖,2000年获中华医学优秀期刊银奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:12609