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油菜BnHMGB2基因的克隆及表达分析
  • ISSN号:1673-5102
  • 期刊名称:植物研究
  • 时间:2012.11.11
  • 页码:724-730
  • 分类:S565[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]西北师范大学生命科学学院,兰州730070, [2]甘肃农业大学农学院,兰州730070
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金(30960065;31160089;31070358);甘肃省高等学校基本科研业务费项目
  • 相关项目:荒漠植物红砂C1亚组MAP激酶RsMPK2响应逆境胁迫的调控
中文摘要:

通过RACE技术从陇油6号油菜中克隆得到了一种新的BnHMGB2基因的cDNA,全长823bp,其中包括438bp的开放阅读框,131bp的5’非翻译区(5’UTR),253bp的3’非翻译区(3,UTR)。与拟南芥AtHMGB2的同源性达到了87.4%,因此命名为BnHMGB2(GenBank登录号:JN807314)。该基因编码145个氨基酸的蛋白质,分子量15.9KDa,等电点为5.63。实时荧光定量PCR结果表明该基因在油菜根、茎、叶、下胚轴均有表达,根中表达量最高。同时,该基因的表达受低温胁迫的诱导,表明该基因在油菜适应低温胁迫的过程中发挥作用。

英文摘要:

A new cDNA BnHMGB2 was isolated from Brassica napus long you6 by RACE. The cloned full- length cDNA was 823 bp, contained a 438 bp ORF, a 5'untranslated region (5-UTR) of 131 bp, and a 3'un- translated region (3'UTR) of 253 bp. The nucleotide sequence of BnHMGB2 was 87.4% identical with the Ara- bidopsis thaliana AtHMGB2, so it was named BnHMGB2( GenBank accession: JN807314). BnHMGB2 encoded a protein of 145 amino acids with a deduced molecular weight of about 15.9 KDa and with a PI of 5.63. Analysis by real-time RT-PCR indicated that BnHMGB2 was expressed in root, stem, leaf and hypocotyl of B. napus and relatively higher abundance was observed in root tissue. Sequence analysis indicated that the BnMKK2 :protein exhibited closest homology to MAPKK which is responded to cold stress, and BnHMGB2 played an important role in defending cold stress.

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期刊信息
  • 《植物研究》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:东北林业大学
  • 主编:付玉洁
  • 地址:哈尔滨市和兴路26号东北林业大学
  • 邮编:150040
  • 邮箱:duanxihua828@163.com
  • 电话:0451-82190611
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-5102
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1480/S
  • 邮发代号:14-77
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 被引量:13014