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孟加拉虎粪便放线菌的分离及其多样性
  • ISSN号:0001-6209
  • 期刊名称:微生物学报
  • 时间:0
  • 页码:816-824
  • 分类:Q939[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]西北农林科技大学资源环境学院,杨凌712100, [2]云南大学微生物研究所,西南微生物多样性教育部重点实验室,昆明650091, [3]云南野生动物园,昆明650091
  • 相关基金:国家自然科学基金(30900002和21062028);国家重大专项(2009ZX09302-003);美国NIH项目(1P41GM086184-01A1)
  • 相关项目:西南地区5种特有动物粪便放线菌多样性研究
中文摘要:

【目的】建立有效分离动物粪便放线菌的方法,认识孟加拉虎粪便放线菌的多样性。【方法】从预处理、抑制剂、培养基三个方面考虑,采用平板稀释的分离方法。用细菌通用引物扩增获得放线菌菌株的16SrRNA基因,根据系统发育分析进行鉴定。【结果】孟加拉虎粪便样品中,可培养放线菌的菌落平均数量为1.10×108cfu/g(粪便湿重);对分离到的110株纯培养放线菌的16S rRNA基因部分序列分析表明:它们分布于10个科、12个属,主要是一些菌丝分化程度低的放线菌,如:Arthrobacter、Dietzia、Kocuria、Corynebacterium、Microbacterium等;产丝的放线菌主要以Streptomyces占优势,约占分离到放线菌总数的64%。【结论】干热处理粪便样品可以大大提高放线菌的出菌率;添加多种抑制剂及不含天然成分的组合培养基较适合粪便放线菌的分离;孟加拉虎粪便中可培养放线菌的多样性较丰富。本研究提供的分离动物粪便放线菌的有效方法,为动物粪便放线菌资源的研究和开发利用提供了借鉴作用。

英文摘要:

[ Objective] We studied the isolation methods and diversity of culturable fecal actinobacteria associated with Panthera tigris tigris by using culture-dependent approaches. [ Methods] Fresh fecal samples of healthy Panthera tigris tigris were collected from Yunnan Safari Park. Pretreatment of the samples, isolation media and inhibitors were tested for actinobacteria isolation. 16S rRNA genes of actinobacteria were sequenced and subjected to phylogenetic analysis. [ Results] The abundance of cuhurable actinobacteria was 1.10 ~ l0s cfu/g colony forming units (CFU) per gram of feces (wet weight). We obtained 110 purified cultural actinobacterium strains. The analysis based on 16S rRNA gene sequences showed that these strains were distributed in 10 different families and 12 genera of actinobacteria at least, and most of them were non-filamentous, such as Arthrobacter, Dietzia, Kocuria, Corynebacterium and Microbacterium. Streptomyces was the mainly classical filamentous actinobacteria, and up to 64% of total. [ Conclusion ] Drying and heating up the fecal samples can greatly increase the rate of the actinobacteria. Many kinds of inhibitors and chemical defined media are suitable for isolation of fecal actinobacteria. The cuhurable actinobacteria are abundant in Panthera tigris tigris feces. Our study found an effective method to isolate animals' fecal actinobacteria and it's useful for studying and exploiting animals' fecal actinobacteria.

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期刊信息
  • 《微生物学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国微生物学会 中国科学院微生物研究所
  • 主编:谭华荣
  • 地址:北京市朝阳区北辰西路3号中国科学院微生物研究所B401室
  • 邮编:100101
  • 邮箱:actamicro@sun.im.ac.cn
  • 电话:010-64807516
  • 国际标准刊号:ISSN:0001-6209
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1995/Q
  • 邮发代号:2-504
  • 获奖情况:
  • 国家优秀期刊二等奖,中科院优秀期刊二等奖,中国科协首届优秀科技期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21879