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鸭坦布苏病毒AH—F10株全基因组的分子克隆与序列分析
  • ISSN号:1673-4696
  • 期刊名称:《中国兽医科学》
  • 时间:0
  • 分类:S852.659.6[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]安徽农业大学动物科技学院,安徽合肥230036, [2]中国农业科学院上海兽医研究所,上海200241
  • 相关基金:安徽省教育厅重点科研项目(KJ2012A124);安徽省年度重点科研项目(11070303024);公益性农业科研专项(201003012,0080319);国家高技术研究发展计划(863)项目(2011AA10A200)
中文摘要:

为了解鸭坦布苏病毒安徽分离株AH-F10的分子特征,利用RT—PCR方法对其全基因组序列进行了克隆,并将全基因组及其推导的氨基酸序列与参考毒株进行序列比对及系统进化分析。结果显示,毒株AH—F10的全基因组序列长10990nt,含有1个大的阅读框架,两侧各有一个非编码区(Untranslationregion,UTR)。序列比对结果表明,AH—F10株与13株参考毒株的基因编码区具有较高的氨基酸序列同源性,其中与江苏JS20LO株的同源性最高,达98%。研究还发现,鸭坦布苏病毒各分离株的5IUTR的序列表现一定程度的变异,AH—F10株与参考株的核苷酸序列同源性在94%~97%之间。此研究结果为进一步了解鸭坦布苏病毒的遗传变异及构建该病毒的反向遗传学操作系统奠定了基础。

英文摘要:

To understand the molecular characteristics of duck Tembusu virus(TMUV) AH-F10 strain isolated from Anhui Province,the complete genomic sequence of AH-F10 strain was determined and ana- lyzed. The results showed that the full-length genome of TMUV AH-F10 strain was 10 990 nt in length, which only had one open reading frame. There were two untranslation regions(UTRs) in the bilateral ends. Compared with 13 reference strains, AH-F10 strain shared 98~ of amino acid sequence homology with JS2010 strain from Jiangsu Province, which suggested that AH-F10 and JS2010 may have evoluted from the same ancestor. However,the 5UTR of TMUV showed genetic variability among all strains,and the sequence similarity of 94% to 97% was observed between the AH-F10 strain and the other reference strains. This study lays foundations for understanding the genetic variation and constructing the reverse genetic system of TMUV.

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期刊信息
  • 《中国兽医科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院兰州兽医研究所
  • 主编:殷宏
  • 地址:兰州市盐场堡徐家坪1号
  • 邮编:730046
  • 邮箱:zgsykx@zgsykx.com
  • 电话:0931-8310086 8342195
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-4696
  • 国内统一刊号:ISSN:62-1192/S
  • 邮发代号:54-33
  • 获奖情况:
  • 2003年获第二届国家期刊奖百种重点期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:6141