采用ISSR技术对马氏珠母贝进行PCR扩增,100个引物筛选出48个呈阳性反应的引物。对影响ISSR-RPCR反应的Mg^2+浓度、模板浓度、Taq酶浓度、引物退火温度和反应循环数进行了优化,并对甲酰胺对试验的影响进行了初步探讨。结果表明:优化的马氏珠母贝ISSR反应条件为①反应体系2.5μl 10×buffer,镁离子浓度1.5mmol/L,Taq酶1.0U,200nmmol/L ISSR引物,模板浓度为50ng/μl,2%甲酰胺,0.10mmol/L dNTP,加双蒸水至总体积25μl;②反应程序预变性94℃,5min;变性94℃,30s;退火52℃,1min;延伸72℃,2min;39个循环;延伸72℃,7min。