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基于cox2基因的细粒棘球绦虫环介导等温扩增检测方法的初步建立
  • ISSN号:1000-7423
  • 期刊名称:《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R383.21[医药卫生—医学寄生虫学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]新疆农垦科学院,省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室,石河子832000, [2]石河子大学,石河子832000
  • 相关基金:新疆生产建设兵团科技创新团队(No.2014CC004);新疆生产建设兵团科技攻关项目(No.2014BA002);新疆生产建设兵团国际科技合作项目(No.2013BC001)
中文摘要:

目的 建立一种安全、快速、高效的细粒棘球绦虫(Echinococcus granulosus)的诊断方法——环介导等温扩增方法(loop-mediated isothermal amplification, LAMP)。 方法 根据细粒棘球绦虫线粒体细胞色素c氧化酶亚基2(cytochrome c oxidase subunit 2, cox2)基因序列, 设计4条LAMP引物, 建立LAMP检测方法, 采用LAMP法和常规PCR法检测细粒棘球绦虫、泡状带绦虫(Cysticercus tenuicollis )、扩展莫尼茨绦虫(Moniezia expansa)、羊曲子宫绦虫(Thysaniezia ovilla)、中点无卵黄腺绦虫(Avitellina centripunctata)、鞭毛线虫(flagella nematodes)、肝片吸虫(Fasciola hepatica)、多房棘球绦虫(E. multilocularis)和捻转血矛线虫(Haemonchus contortus)等9种寄生虫的DNA以验证LAMP法的特异性; 分别用LAMP法和常规PCR法检测梯度稀释的含cox2基因片段的细粒棘球绦虫标准质粒后, 比较两者的敏感性。采用LAMP、PCR和夹心ELISA法检测50份犬粪样, 计算细粒棘球绦虫cox2基因的阳性率, 评价所建立的LAMP法检测效果。 结果 LAMP法的特异性验证结果表明, 仅在以细粒棘球绦虫DNA为模板的反应体系中出现特异性产物。LAMP法在细粒棘球绦虫标准质粒浓度为16.09 ag/μl时仍可见梯状条带, 而常规PCR法仅可检测到浓度为16.9 fg/μl以上的质粒, LAMP法灵敏性是常规PCR法的1 000倍。对50份犬粪中细粒棘球绦虫DNA的检测结果显示, PCR、LAMP和夹心ELISA法检测结果相同, 阳性率为8.0%(4/50)。 结论 基于细粒棘球绦虫线粒体cox2基因的LAMP检测方法操作方便、特异性较强、敏感性较高, 适于细粒棘球绦虫感染犬的快速检测。

英文摘要:

Objective To establish a loop-mediated isothermal amplification(LAMP) assay for rapid detection of Echinococcus granulosus cytochrome c oxidase subunit 2(cox2) gene in dog feces. Methods Four primers were designed based on the cox2 gene of Echinococcus granulosus and were used for the LAMP assay. LAMP assay and conventional PCR were performed to detect E. granulosus, Cysticercus tenuicollis, Moniezia expansa, Thysaniezia ovilla, Avitellina centripunctata, flagella nematode, Fasciola hepatica, E. multilocularis and Haemonchus contortus, and the specificity of LAMP was evaluated. The sensitivity of LAMP was compared with that of conventional PCR using gradient dilutions of recombinant plasmid carrying cox2 fragment of E. granulosus. In addition, LAMP, conventional PCR and ELISA were performed to detect E. granulosus in 50 dog fecal samples. The positive rate of E. granulosus was calculated and the efficacy of LAMP was evaluated. Results The LAMP assay only produced specific bands for E. granulosus among various species. The sensitivity of LAMP for E. granulosus was 16.09 ag/μl, which was 1 000 times higher than that of conventional PCR(16.9 fg/μl). Regarding the fecal samples, the three methods revealed same positive rate of 8.0%(4/50). Conclusion The LAMP assay is a convenient method to detect E. granulosus based on the cox2 gene with a high specificity and sensitivity, revealing a suitable technique for rapid detection of E. granulosus in dogs.

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期刊信息
  • 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中华预防医学会 中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所
  • 主编:汤林华
  • 地址:上海市瑞金二路207号右楼3F
  • 邮编:200025
  • 邮箱:zgjsczz@vip.163.net
  • 电话:021-54562376
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-7423
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1248/R
  • 邮发代号:4-362
  • 获奖情况:
  • 1997年被中华预防医学会评为先进编辑部,2000年荣获中华预防医学会系列杂志优秀期刊一等奖,2001年荣获中华预防医学会2001年优秀期刊二等奖,2003年荣获2001-2002年中华预防医学会系列杂志优...,2009年获“百种中国杰出学术期刊”奖,2010年荣获上海市科技期刊审计优秀奖,2011年遴选为第二届“中国精品科技期刊”,获第三届“RCCSE中国权威学术期刊”,2013年荣获国家卫生计生委首届优秀期刊,2013年荣获第四届华东地区优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:11792