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利用酵母双杂交系统筛选猪Calsarcin-1基因相互作用蛋白
  • ISSN号:0578-1752
  • 期刊名称:《中国农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:Q51[生物学—生物化学] Q946.1[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,中国农业科学院家养动物遗传资源与种质创新重点开放实验室,北京100193, [2]华中农业大学动物医学院,武汉430070
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金项目(30500359),国家“863”计划(2006AA102135,2008AA102143),国家“973”项目(2006CB102105)和中国农业科学院北京畜牧兽医研究所创新团队基金
中文摘要:

【目的】利用酵母双杂交系统研究与猪Calsarcin-1相互作用的蛋白,了解Calsarcin-1在猪骨骼肌纤维类型形成和信号通路的调控功能。【方法】首先用长白猪Calsarcin-1基因构建既无自激活性又无毒性的pGBKT7-CS1诱饵载体;然后从猪的骨骼肌组织样中提取mRNA,利用SMART技术合成并纯化双链cDNA;最后通过酵母双杂交系统的共转化法筛选与Calsarcin-1相互作用的蛋白,在GenBank中比对分析相互作用基因,分析Calsarcin-1在骨骼肌中的功能。【结果】构建了pGBKT7-CS1诱饵载体,获得具有完整3′端的猪骨骼肌单链cDNA,并合成双链cDNA。筛选出4个与Calsarcin-1相互作用的蛋白,经与人的基因比较分析,发现Calsarcin-1与α-1肌动蛋白和α-3辅肌动蛋白互作,与骨骼肌Z线附近结构形成有关;与肌集钙蛋白-1和肌钙蛋白T3互作,影响钙离子的调控。【结论】分析所筛选出的蛋白功能,推测Calsarcin-1通过结合这些蛋白,维持细胞结构的稳定,影响相关蛋白的钙离子结合能力,从而参与钙离子调控;而钙离子浓度的变化将影响到其它控制肌纤维分化的因子,或其它调控通路,共同调节快慢肌纤维的形成与转化。

英文摘要:

[Objective] The function of Calsarcin-1 was studied in the formation of skeletal muscle fiber and signaling pathway regulation through the screening for porcine Calsarcin-1 interacting proteins by yeast two-hybrid system. [Method] The pGBKT7-CS1 bait vector without toxicity or auto-activation was constructed with the Calsarcin-1 gene of Landrace pig, firstly. Then the mRNA was isolated from the skeletal muscle of the adult Landrace and purified ds-cDNA by SMART technology. Ds-cDNA was amplified by long distance PCR. At last, the Calsarcin-1 interaction proteins were screened through co-transformation with bait vector and ds-cDNA prey library. With the alignment of interacted gene in GenBank, the function of Calsarcin-1 was analyzed. [ Result ] In this study, p GBKT7-CS1 bait expression vector was constructed. The ss-cDNAs of the porcine skeletal muscle with full length 3' end were isolated and the ds-cDNAs were synthesized. Four proteins interacting with Calsarcin-1 were identified. The Calsarcin-1 showed the important function in maintaining the structure of Z line through interacting with ACTA1 and ACTN3, while involved to calcium ion regulation through CASQ1 and TNNT3 possibly. [Conclusion] According to the result, it is presumed that the Calsarcin-1 affected the formation of Z-line and the calcium binding by combination with these identified proteins and participated in the calcium ion regulation and maintaining the cytoskeleton stabilization. By this way, the calcium ion concentration also affected other factors and signaling pathways related to the slow and fast muscle fiber formation and transformation.

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期刊信息
  • 《中国农业科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院 中国农学会
  • 主编:万建民
  • 地址:北京中关村南大街12号中国农业科学院图书馆楼4101-4103室
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zgnykx@caas.cn
  • 电话:010-82109808 82106279
  • 国际标准刊号:ISSN:0578-1752
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1328/S
  • 邮发代号:2-138
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵“双高”期刊,第三届中国出版政府奖提名奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:85620