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对称蛋白质序列与结构关系研究
  • ISSN号:1004-0374
  • 期刊名称:《生命科学》
  • 时间:0
  • 分类:Q51[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]华中科技大学物理学院生物分子物理与模拟研究组,武汉430074
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30525037, 30870678),致谢:感谢参加该文研究工作的李明锋、何毅、陈长军、周睿、许瑞珍、王晓春、纪晓峰、刘秀华、杨艾红、陈寒林、沈小娟和彭东海等.
中文摘要:

进化的观点认为,蛋白质结构的对称性是基因复制和融合的结果,但是由于在长期进化过程中的氨基酸突变,绝大多数现有的蛋白质序列都失去了这种直观的重复性特征。该文简要地回顾了国际上发展的寻找蛋白质序列中重复片段的方法,重点介绍了作者自己提出的分析蛋白质序列和结构对称性的方法以及在蛋白质对称结构形成机理方面的初步工作,并系统分析了各类对称折叠子的序列与结构关系,发现它们的序列都具有隐含的与结构相同的对称性,或者说序列的对称性决定结构的对称性。

英文摘要:

From the view of evolution,the symmetry of protein structure is the result of gene duplication and fusion.However,due to the mutation in evolution,most of proteins have lost their repetitive signals in sequences.In this paper we will briefly review the methods of detecting repeats in protein sequences.In particular,we shall introduce our methods of detecting sequence and structure symmetries of proteins as well as our studies in the mechanism of the formation of symmetric structures of proteins.We investigated the sequence-structure of different types of folds and found their hidden sequence symmetries as the structures or sequence symmetry encodes structural symmetry.

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期刊信息
  • 《生命科学》
  • 北大核心期刊(2008版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:国家自然科学基金委员会生命科学部 中国科学院生命科学与生物技术局 中国科学院生命科学和医学学部 中国科学院上海生命科学研究院
  • 主编:王恩多
  • 地址:上海岳阳路319号31号楼B座403中国科学院上海文献情报中心
  • 邮编:200031
  • 邮箱:CBLS@SIBS.AC.CN
  • 电话:021-54922830
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-0374
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1600/Q
  • 邮发代号:4-628
  • 获奖情况:
  • 1996年获上海市优秀科技期刊评比一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版)
  • 被引量:9112