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核磁共振代谢组学数据预处理中的自适应分段积分方法
  • ISSN号:0251-0790
  • 期刊名称:《高等学校化学学报》
  • 时间:0
  • 分类:O657.2[理学—分析化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]厦门大学物理系,固体表面物理化学国家重点实验室,厦门361005
  • 相关基金:国家卫生部科学研究基金-福建省卫生教育联合攻关计划(批准号:WKJ2008-2-36)和国家自然科学基金(批准号10605019)资助.中国科学院长眷应用化学研究所裴奉奎研究员、中国科学院武汉物理与数学研究所唐惠儒研究员、北京核磁共振中心夏斌教授以及中国科学院上海药物研究所林东海研究员等专家对本工作提出一些建议,特此致谢!
中文摘要:

提出一种用于核磁共振代谢组学数据预处理的自适应分段积分方法.通过计算各数据点统计特性,并根据相邻数据点的统计差特性进行自适应积分,克服了目前普遍采用的等间隔分段积分法可能存在的缺陷(如统计差异性相反的信号相互抵消、微弱特征信号被掩盖及谱图信噪比下降等),从而避免了对后续统计分析所产生的负面影响.为比较自适应分段积分和等间隔积分对数据预处理的效果,分别采用计算机模拟数据和饮食差异人群两种模型进行分析.研究结果表明,新方法能够有效地削弱噪声和非特异信号的影响,提高后续的主成分分析结果的可靠性,使代谢组学数据分析更具生物学意义.

英文摘要:

A novel adaptive binning method was statistical discrepancy of each spectral data point is proposed for NMR metabonomic data preprocessing. The estimated, then the contiguous data points are integrated adaptively based on the statistical discrepancy. Comparing to the fixed width binning, the proposed method can overcome the following negative effects on the subsequently statistical analysis. For example, signals with opposite statistical discrepancies may be superposition in a same region. Both simulated NMR data and experimental spectra from dietary intervention individuals were employed to validate the performance of the adaptive binning. The results show that the proposed method effectively mitigates disturbance from spectral noises and signals without statistical significance. It can increase the interpretability of PCA loading results so that the metabonomics results are more biological significant.

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期刊信息
  • 《高等学校化学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:吉林大学 南开大学
  • 主编:周其凤
  • 地址:吉林大学南胡校区
  • 邮编:130012
  • 邮箱:cjcu@jlu.edu.cn
  • 电话:0431-88499216
  • 国际标准刊号:ISSN:0251-0790
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1131/O6
  • 邮发代号:12-40
  • 获奖情况:
  • 首届及第二届国家期刊奖,连续两届“百种中国杰出学术期刊”,中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国科学引文索引(扩展库),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:50676