Sac10b蛋白家族在古菌中高度保守,但其生理功能尚属未知。近三年来,Sac10b家族蛋白已经成为古菌研究中的一个热点。长期以来,该家族蛋白一直被认为是DNA 结合蛋白,但本实验室最近发现,该家族蛋白在细胞内与RNA结合。本课题拟分析芝田硫化叶菌Ssh10b(Sacl0b同源蛋白)与含二、三级结构的RNA分子的相互作用以及Ssh10b对RNA稳定性(特别是二、三级结构的热稳定性)的影响;寻找与硫矿
Sac10b蛋白家族是古菌中分布最广泛的一类核酸结合蛋白,生理功能未知。长期以来,Sac10b家族蛋白被认为是DNA结合蛋白,但本实验室先前的工作提示,该蛋白家族的生理结合靶位是RNA。本项目研究了Sac10b家族蛋白与RNA的相互作用,分析了在最适生长温度不同古菌中该家族蛋白的表达水平和生化性质,并对该家族蛋白的生理功能进行了遗传学分析。本研究发现(1)硫化叶菌Sac10b同源蛋白与有结构RNA的结合强于与无结构RNA;可降低RNA二级结构的稳定性、增强RNA的热稳定性;(2)在硫化叶菌细胞中,mRNA可能是Sac10b同源蛋白的主要结合靶位;(3)Sac10b家族蛋白的表达水平、热稳定性以及与RNA的结合亲和力与宿主菌的最适生长温度呈正相关;(4)Sac10b同源编码基因的缺失导致中温产甲烷古菌在基本培养基中生长缓慢,多个基因的表达水平发生改变。上述研究揭示了Sac10b家族蛋白的基本生化性质,为阐明该蛋白家族的生理功能提供了重要启示。本研究还发现了一个新的在泉古菌中高度保守的核酸结合蛋白Cren7,并证明该蛋白为染色体结构蛋白。这一发现丰富了关于古菌小分子核酸结合蛋白的认识。