利用木薯野生种(M.carthaginensis)与木薯(M.esculenta)高淀粉栽培品种杂交构建多样性丰富的实验群体,连同原有2个实验群体,完成其有关产量和块根品质的多年度表型鉴定。综合采用cDNA-AFLP、EST-SSR和多样性芯片(DArT)技术,发掘高通量、高质量的分子标记,完成对实验群体基因片段多态性检测,获得具有1500个以上等位基因标记的木薯分子图谱。根据已有的100余个SSR锚定标记,整合CIAT合作实验室已发表包含700个标记的初级遗传图谱,形成超过2000个标记的木薯高密度分子整合遗传图谱。在此基础上实现对淀粉率、块根产量、收获指数等重要经济性状的精细QTL分析,并对主效QTL进行标记转换,建立PCR基础上的快速检测方法,形成高效的分子标记辅助育种(MAS)技术体系。为能源木薯的遗传改良提供有力的工具,也为关键基因的图位克隆创造条件。