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基因IV型戊型肝炎病毒的分子起源及流行预测研究
  • 项目名称:基因IV型戊型肝炎病毒的分子起源及流行预测研究
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:30872158
  • 申请代码:H2609
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2009-01-01-2011-12-31
  • 项目负责人:郑英杰
  • 负责人职称:副教授
  • 依托单位:复旦大学
  • 批准年度:2008
中文摘要:

系统地研究HEV流行病学、病毒学和分子进化特征。人急性戊肝表现为春季、男性、中老年高发。在440例患者血清和5300份猪胆汁中,HEV RNA阳性率分别为57.7%、5.0%。人和猪HEV RNA检出率时间变化趋势相似,前者出现峰谷时间比后者"延后"约3-4个月。HEV-4型占99.0%,可被进一步划分为China1-11个亚型。人/猪HEV地区多呈现地区聚集性,但因地区而异。RdRP 516-618 nt区域很可能具有HEV-3、HEV-4的型间特异性位点,进化压力均以中性选择为主;分子进化速率约为2.07~4.66×10-3/位点/年,tMRCA可追溯到1860年;HEV-1和HEV-2间、HEV-3和HEV-4间进化分歧时间分别为1912年和1890年。ORFs结构特征可作为HEV分型方法之一;核苷酸同源性>76%和>94%、87%、84%分别为基因型间和HEV-1、HEV-3、HEV-4亚型的划分依据。识别了2株型间和5株型内重组株,呈现四种感染模式猪-猪重组株感染猪或人、人-人重组株感染猪和人-猪重组株感染猪。这些结果为戊肝具有"人→猪→人"双向传播模式奠定了基础。

结论摘要:

英文主题词hepatitis e, epidemiology, sequence analysis, recombination, phylodynaymics


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 19
  • 7
  • 0
  • 0
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