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基于粗粒化元胞自动机的生物序列可视化分析与病毒动力学模型研究
  • 项目名称：基于粗粒化元胞自动机的生物序列可视化分析与病毒动力学模型研究
  • 项目类别：地区科学基金项目
  • 批准号：60661003
  • 申请代码：F010805
  • 项目来源：国家自然科学基金
  • 研究期限：2007-01-01-2009-12-31
  • 项目负责人：肖绚
  • 负责人职称：教授
  • 依托单位：景德镇陶瓷学院
  • 批准年度：2006
中文摘要：

项目基于粗粒化元胞自动机建立生物序列可视化分析模型和病毒动力学模型。此生物序列可视化分析模型的特点在于生成生物序列图像过程中碱基对应的点的状态是由此碱基和它前后所有碱基共同决定的。在此基础上建立精确性分析框架下的基因序列扰动"放大"平台，基于灰色理论的模式识别方法，提取生物序列特征。项目将基于此模型研究生物序列的自动分类技术，挖掘蛋白质序列的特征以及不同特征与亚细胞定位、三维结构以及蛋白质功能之间的关系。本项目还将用此可视化分析模型研究不同流行性病毒的起源和进化，研究不同元胞自动机运算规则所对应的基因调控规律。此模型具有发展成为一种新的基因分析和识别以及探讨基因调控规律的新方法。 项目还将基于二维概率粗粒化元胞自动机对病毒动力学进行研究，考虑时空特性在病毒感染的发展和爆发中起到的重要特性，模拟不同药物作用下的治疗效果定量研究。这种概念模型对指导新药设计具有应用前景。

中文主题词： 基因序列可视化;粗粒化元胞自动机;结构功能预测;病毒动力学
结论摘要：

英文主题词Gene sequence visualization; Coarse-graining cellular automata; Prediction for structure and function;Virus dynamics

成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 26
  • 8
  • 0
  • 1
  • 0
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获奖
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