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猪背膘厚主效基因捕获及变异序列构建
  • 项目名称:猪背膘厚主效基因捕获及变异序列构建
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:31201781
  • 申请代码:C170102
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2013-01-01-2015-12-31
  • 项目负责人:张龙超
  • 依托单位:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 批准年度:2012
中文摘要:

中外猪种背膘厚的巨大差异有着极其复杂的分子遗传机制。申请人前期在构建的大白猪×民猪F2设计资源群体中,运用全基因组关联研究(GWAS)方法,检测发现7号染色体上存在8个与背膘厚性状显著关联的SNP位点,区间跨度1.8Mb,包含了24个已知基因。本项目旨在及时利用前期研究的成果,通过DNA水平、RNA表达水平开展背膘厚性状主效基因捕获。拟利用单倍型分析、选择性清除分析获得最小显著区间,通过民猪、大白猪GWAS区间内所有基因表达规律及表达差异研究缩减候选基因数量,结合生物信息学综合分析捕获主效基因。以主效基因所在单倍型开展关联分析,以H+民猪、H-大白猪分别作为QQ、qq型个体,开展主效基因全基因序列片段靶向捕获及重测序,获得两猪种间变异位点,构建出猪种间变异位点序列。本项目的实施不但为动物复杂性状GWAS后捕获主效基因方法研究方面有重要理论意义,且为以降低背膘厚为目的的分子选育提供理论基础。

结论摘要:

英文主题词backfat thickness;GWAS;HMGA1;major gene;pig


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
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  • 0
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