中外猪种背膘厚的巨大差异有着极其复杂的分子遗传机制。申请人前期在构建的大白猪×民猪F2设计资源群体中,运用全基因组关联研究(GWAS)方法,检测发现7号染色体上存在8个与背膘厚性状显著关联的SNP位点,区间跨度1.8Mb,包含了24个已知基因。本项目旨在及时利用前期研究的成果,通过DNA水平、RNA表达水平开展背膘厚性状主效基因捕获。拟利用单倍型分析、选择性清除分析获得最小显著区间,通过民猪、大白猪GWAS区间内所有基因表达规律及表达差异研究缩减候选基因数量,结合生物信息学综合分析捕获主效基因。以主效基因所在单倍型开展关联分析,以H+民猪、H-大白猪分别作为QQ、qq型个体,开展主效基因全基因序列片段靶向捕获及重测序,获得两猪种间变异位点,构建出猪种间变异位点序列。本项目的实施不但为动物复杂性状GWAS后捕获主效基因方法研究方面有重要理论意义,且为以降低背膘厚为目的的分子选育提供理论基础。
英文主题词backfat thickness;GWAS;HMGA1;major gene;pig