中文摘要：

真核生物基因调控元件的寻找/识别是基因表达调控研究的一个重要方向。现有基于DNA基因表达微阵列数据的大多数方法主要在一组共表达基因的上游调控区实现对基因调控元件的寻找/识别，但共表达基因不是共调控基因的充分条件。本项目主要研究在一组正负共调控基因的非编码区寻找/识别调控元件的方法/算法，属于该领域前沿探索性的基础研究。本项目的研究包括真核生物正负共调控基因组的建立与特征分析；基于一组正负共调控基

结论摘要：

该项目是小额探索类课题，主要研究转录因子结合位点的识别方法，研究时间从2006年1月至2006年12月。该项目在执行过程中，为了获得更好的研究效果，将研究内容扩展为周期共调控基因的识别、转录因子结合位点的识别和局部基因表达调控网络的构建。 围绕着以上3个问题，项目开展了2个改进主成份分析算法、1个改进非负矩阵因子分解算法、1个改进独立成分分析算法、1个改进吉布斯抽样算法、1个改进关联规则算法和1个改进遗传算法等7个基本算法的研究工作，最后将2个改进主成分分析和改进非负矩阵因子分解算法用于解决周期共调控基因的识别问题，将改进吉布斯抽样算法用于解决转录因子结合位点的识别问题，将改进关联规则算法和改进遗传算法结合用于解决局部基因表达调控网络的构建问题，分别形成了解决上述3个问题的新方法。用理论分析和计算机实验证实了各种新方法的可行性和有效性，获得了一些对实验生物学有指导意义的结果。通过该项目的研究，课题组探索到了一套有效的研究思路和研究方法，凝聚了研究力量，培养了1名中青年学术与技术带头人、1博士生和4硕士生，为后续研究奠定了良好的基础。