中文摘要：

蛋白质自剪切是存在于生命体内，在不需要其它酶的作用下，发生在蛋白质水平上的自我催化过程。这一特殊的生命现象不但给中心法则增添了全新的内容，而且在蛋白纯化，设计产生特殊蛋白等方面具有广泛的应用前景。该项目是前一面上项目"蛋白质自剪切生物信息学"的继续，目前我们已通过生物信息学手段找到多个与蛋白自剪切效率相关的一些特性并建立了具有综合处理能力的蛋白自剪切数据库，现急需进一步研究并通过实验验证。项目的实施不但有望给蛋白自剪切机制提供重要线索，而且会给蛋白自剪切的应用提供重要参考。

结论摘要：

得益于“基于数据库的蛋白自剪切综合分析及实验”国家自然科学基金面上项目的支持，在过去的三年里，我们不但建立和完善了“蛋白质内含子数据库”，而且在此基础上进行研究发现了40个新的蛋白内含子，其中有7个有蛋白纯化，蛋白质工程方面的开发价值。对蛋白质内含子密码子的组成以及蛋白质内含子的演化进行研究，发现蛋白质内含子的演化有一个逐渐适应外显子环境的过程。而且，内含子的密码子组成变化基本反映了内含子插入外显子的时间长短。在自剪切机制研究方面，我们发现内含子序列中甘氨酸在三维结构和自煎切功能方面的独特作用。同时发现两个新的特征序列，以及它们各自在三维结构和功能方面的重要作用。目前在继续进行蛋白质内含子的进化研究之处，还在新蛋白质内含子的应用开发方面展开研究。