鱼类隐鞭虫是鞭毛类原生动物,其分类和系统发育关系很不明确。本项目拟通过形态学研究、虫体分离、分子系统发育研究、交叉感染实验等四个方面,以我国鱼类隐鞭虫为主要研究对象,通过国际合作和利用基因库中已有的资源,进行全面的系统发育研究。本研究旨在阐明鱼类隐鞭虫乃至整个波豆亚目的起源及系统发育关系,用分子数据佐证形态分类学,厘清一些误定和疑难种,理清鱼类隐鞭虫分类学的问题,澄清其分类学中的混乱局面。同时根据实验结果,分析锥虫与寄主之间的协同进化模式,评价其宿主特异性,探讨隐鞭虫病的流行规律。本项目的完成将有助于解决鱼类隐鞭虫在起源和进化上的争议,为完善鞭毛虫类群的分类系统提出有力的理论依据,并为锥虫疫情的预测预报、快速检测、病原追踪以及如何防止交叉感染等有效策略的制订提供理论基础。