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海带配子体-孢子体世代间表达基因差异分析研究
  • 项目名称:海带配子体-孢子体世代间表达基因差异分析研究
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:40606035
  • 申请代码:D0609
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2007-01-01-2009-12-31
  • 项目负责人:王绪敏
  • 负责人职称:副研究员
  • 依托单位:中国科学院北京基因组研究所
  • 批准年度:2006
中文摘要:

本研究以海带“单倍体十号”(雌性配子体克隆)为实验材料,构建了其cDNA文库,并对文库进行了EST测序和生物信息学分析。采用改进的异硫氢酸胍法提取海带雌性配子体克隆总RNA,构建了其cDNA文库,并对文库进行随机测序,对形成的805条有效表达序列标签(EST)进行了初步分析。结果表明cDNA文库共包含了1.31×106个原始克隆,重组率为87%;805个有效ESTs进行拼接后有119个与已知功能基因同源;使用GO(Gene Ontology)分类方法对119个ESTs进行分类,其中109个可以在细胞组分、分子功能和生物学过程三个大类中得到分类。本研究为后续开展海带的功能基因分离、克隆和功能基因组学研究奠定了基础。

结论摘要:

英文主题词Analysis of ESTs;Laminaria japonica;gametophyte;sporophyte


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