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DNA羟甲基化修饰对小鼠胚胎干细胞染色质结构与基因转录的影响
  • 项目名称:DNA羟甲基化修饰对小鼠胚胎干细胞染色质结构与基因转录的影响
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:31200966
  • 申请代码:C060602
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2013-01-01-2015-12-31
  • 项目负责人:谭理
  • 依托单位:复旦大学
  • 批准年度:2012
中文摘要:

DNA甲基化影响染色质结构与功能,在发育与疾病中发挥重要作用。甲基胞嘧啶(5mC)可以被TET家族蛋白氧化成羟甲基胞嘧啶(5hmC)、甲酰胞嘧啶(5fC)及羧基胞嘧啶(5caC)。5hmC可能是5mC去甲基化的一种中间产物,同时也被认为是一种广泛存在的新型表观遗传修饰。最近我们课题组与国外其他几个实验室同时报道了小鼠胚胎干细胞中Tet1与5hmC的全基因组分布规律,但5hmC对染色质结构与功能的影响还不清楚。因此,我们计划构建Tet1/2基因双敲除的小鼠胚胎干细胞,采用MeDIP-seq(甲基化DNA免疫沉淀测序)、ChIP-seq(染色质免疫沉淀测序)及RNA-seq等技术检测野生型与Tet1/2双敲除小鼠胚胎干细胞在染色质结构与基因转录方面的差异。本项目的研究结果将阐明小鼠胚胎干细胞中TET蛋白及DNA羟甲基化修饰对染色质结构与基因转录的调控作用。

结论摘要:

英文主题词TET proteins;5-hydroxymethylcytosine;5-methylcytosine;histone methylation;gene transcription


成果综合统计
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