DNA计算是NP完全问题和其它难解问题的潜在解决方案之一,随着DNA计算研究的逐渐深入,现有基于穷举方法的DNA计算机算法中存在的解空间指数爆炸问题日益突出,已成为限制DNA超级计算应用的瓶颈因素,这一问题源于现有DNA计算模型的不可扩展性.为此,本项研究将传统电子计算机并行处理的策略、方法和技术引入DNA超级计算中,采用理论分析和生物实践相结合的方法,拟通过对DNA分子生物计算的并行处理机制、可扩展的DNA计算模型及其上求解SAT和最大团NP完全问题DNA计算机算法等关键问题的研究,提出一种具有良好可扩展性的DNA计算机新模型,应用该模型可设计出能显著减少算法中DNA链数和链长的DNA计算机算法. 本项研究不仅为DNA生物分子计算模型和算法设计提供新的思路,从而为DNA计算机的更广泛应用奠定基础,还将丰富传统并行处理的研究内容,推动分子生物计算和理论计算机科学的研究与发展.
英文主题词DNA-based supercomputation; scalability; parallel processing; NP-Complete problem