在原有工作基础上,针对三种试验设计(1)种子单粒测定、标记基因型信息来自种子胚和性状表型值来自同一粒种子胚乳;(2)种子单粒测定、标记信息来自母体及下一代种子胚;(3)在随机交配产生后代家系基础上种子混合测定,标记信息来自已知植株(或株系)。应用极大似然估计法、Score统计量、FDR检验、贝叶斯统计分析方法、混合线性模型统计分析方法、EM算法和遗传算法等,从理论上构建一系列基于三倍体遗传模型的胚乳性状多QTL定位方法,包括基于胚乳基因上位性效应的多QTL作图统计分析方法、基于胚乳基因和母体基因上位性效应的多QTL作图统计分析方法、基于胚乳基因上位性效应和环境互作效应的多QTL作图统计分析方法。用计算机模拟实验验证所建立的胚乳性状多QTL定位方法的有效性和可行性。为实际胚乳性状QTL定位提供理论依据和手段,也为揭示胚乳性状遗传学机理提供参考,同时对谷类作物品质性状遗传改良有重要指导作用
Endosperm trait;QTL mapping;Epistasis;Statistical method;Imprint effect
本项目于2011年获得资助,执行时间是2012年1月至2015年12月,研究内容是基于三种试验设计(1)种子单粒测定、标记基因型信息来自种子胚和性状表型值来自同一粒种子胚乳;(2)种子单粒测定、标记信息来自母体及下一代种子胚;(3)在随机交配产生后代家系基础上种子混合测定,标记信息来自已知植株(或株系)。应用极大似然估计法、贝叶斯等统计分析方法,从理论上构建一系列基于三倍体遗传模型的胚乳性状多QTL定位方法,用计算机模拟验证所建立的胚乳性状多QTL定位方法的有效性和可行性。在资助项目执行期间,我们开展以下方面的研究第一,在禾谷类作物中,种子单粒测定、标记基因型信息来自种子胚和性状表型值来自同一粒种子胚乳,基于E-Bays方法的胚乳性状QTL上位性的研究,分为逆卡方先验和指数先验两种情形进行讨论;第二,在禾谷类作物中,标记基因型信息来自母体植株,胚乳性状表型值来自家系种子单粒测定,建立包含母体效应的胚乳性状QTL定位研究;第三,基于永久性F2群体的印迹QTL定位研究。用计算机模拟验证所建立的胚乳性状多QTL定位、印迹QTL定位方法的有效性和可行性。为实际胚乳性状QTL定位提供理论依据和手段,同时对谷类作物品质性状遗传改良有重要指导作用。在以上研究的同时,我们资助对H7N9禽流感病毒模型的全局动态分析等方面的研究,取得一定的成绩.资助期间共发表论文8篇,其中2篇被SCI收录。另SCI收录杂志接受一篇,另有多篇论文在撰写之中,已基本完成预期目标。