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禾谷类作物胚乳性状多QTL定位统计方法研究
  • 项目名称:禾谷类作物胚乳性状多QTL定位统计方法研究
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:31171448
  • 申请代码:C130101
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2012-01-01-2015-12-31
  • 项目负责人:温永仙
  • 依托单位:福建农林大学
  • 批准年度:2011
中文摘要:

在原有工作基础上,针对三种试验设计(1)种子单粒测定、标记基因型信息来自种子胚和性状表型值来自同一粒种子胚乳;(2)种子单粒测定、标记信息来自母体及下一代种子胚;(3)在随机交配产生后代家系基础上种子混合测定,标记信息来自已知植株(或株系)。应用极大似然估计法、Score统计量、FDR检验、贝叶斯统计分析方法、混合线性模型统计分析方法、EM算法和遗传算法等,从理论上构建一系列基于三倍体遗传模型的胚乳性状多QTL定位方法,包括基于胚乳基因上位性效应的多QTL作图统计分析方法、基于胚乳基因和母体基因上位性效应的多QTL作图统计分析方法、基于胚乳基因上位性效应和环境互作效应的多QTL作图统计分析方法。用计算机模拟实验验证所建立的胚乳性状多QTL定位方法的有效性和可行性。为实际胚乳性状QTL定位提供理论依据和手段,也为揭示胚乳性状遗传学机理提供参考,同时对谷类作物品质性状遗传改良有重要指导作用

结论摘要:

本项目于2011年获得资助,执行时间是2012年1月至2015年12月,研究内容是基于三种试验设计(1)种子单粒测定、标记基因型信息来自种子胚和性状表型值来自同一粒种子胚乳;(2)种子单粒测定、标记信息来自母体及下一代种子胚;(3)在随机交配产生后代家系基础上种子混合测定,标记信息来自已知植株(或株系)。应用极大似然估计法、贝叶斯等统计分析方法,从理论上构建一系列基于三倍体遗传模型的胚乳性状多QTL定位方法,用计算机模拟验证所建立的胚乳性状多QTL定位方法的有效性和可行性。在资助项目执行期间,我们开展以下方面的研究第一,在禾谷类作物中,种子单粒测定、标记基因型信息来自种子胚和性状表型值来自同一粒种子胚乳,基于E-Bays方法的胚乳性状QTL上位性的研究,分为逆卡方先验和指数先验两种情形进行讨论;第二,在禾谷类作物中,标记基因型信息来自母体植株,胚乳性状表型值来自家系种子单粒测定,建立包含母体效应的胚乳性状QTL定位研究;第三,基于永久性F2群体的印迹QTL定位研究。用计算机模拟验证所建立的胚乳性状多QTL定位、印迹QTL定位方法的有效性和可行性。为实际胚乳性状QTL定位提供理论依据和手段,同时对谷类作物品质性状遗传改良有重要指导作用。在以上研究的同时,我们资助对H7N9禽流感病毒模型的全局动态分析等方面的研究,取得一定的成绩.资助期间共发表论文8篇,其中2篇被SCI收录。另SCI收录杂志接受一篇,另有多篇论文在撰写之中,已基本完成预期目标。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 13
  • 0
  • 0
  • 0
  • 0
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