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反义RNA介导的DHRS4基因簇表观遗传学调控机制
  • 项目名称:反义RNA介导的DHRS4基因簇表观遗传学调控机制
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:31100939
  • 申请代码:C060604
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2012-01-01-2014-12-31
  • 项目负责人:苏中静
  • 依托单位:汕头大学
  • 批准年度:2011
中文摘要:

为证实"反义转录本通过RNA介导的方式在表观遗传学水平调控DHRS4基因簇转录活性"的假设,本课题通过RNA干扰和过表达改变DHRS4反义RNA在细胞内的含量,然后检测DHRS4、DHRS4L2和DHRS4L1基因的表达以及启动子DNA甲基化、组蛋白甲基化和乙酰化修饰的变化,证实反义RNA在表观遗传学水平调控DHRS4基因簇的转录活性。在此基础上,进一步采用RNA免疫沉淀和染色质寡核酸亲和沉淀鉴定反义RNA在细胞核内结合的蛋白和DNA分子,详细探讨反义RNA表观遗传学调控基因转录的作用方式。本课题的研究成果有助于明确反义RNA对正义链基因表达的调节作用和表观遗传学水平的调控机制,并揭示参与DHRS4基因簇转录调控的可能因素,为今后进一步研究反义RNA和DHRS4基因簇在人体的功能和意义提供参考资料。

结论摘要:

本课题在生物信息学分析不同物种DHRS4基因结构、RNA剪接亚型的基础上,通过RNAi、qPCR、RNA IP等实验证实人DHRS4反义转录本通过募集调控因子在表观遗传学水平调控正义DHRS4基因簇转录的假设,并提出DHRS4基因簇启动子本身的序列以及反义RNA可能参与了生物进化过程中拷贝基因的转录活性调控。课题还通过RNA pull down鉴定了DHRS4反义RNA在细胞内结合的蛋白,结果提示提示除在表观遗传学调控靶基因表达外,反义RNA也有可能在转录后等多个水平发挥基因表达的调控作用。结和课题有关反义RNA和选择性剪接的研究成果,以及相关的数据库资料分析,我们也提出CD45反义RNA可能参与调控正义CD45 RNA不同剪接亚型的表达,并与临床自身免疫病发病相关的假说,为下一个课题的申请和今后反义RNA结合临床疾病的研究拓开了一个方向。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 3
  • 1
  • 0
  • 1
  • 0
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