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肉牛肌内脂肪相关microRNAs的分离及其在肌内前体脂肪细胞分化中的调控机制
  • 项目名称:肉牛肌内脂肪相关microRNAs的分离及其在肌内前体脂肪细胞分化中的调控机制
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:31000994
  • 申请代码:C170102
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2011-01-01-2013-12-31
  • 项目负责人:李惠侠
  • 负责人职称:副教授
  • 依托单位:南京农业大学
  • 批准年度:2010
中文摘要:

肌内脂肪含量是评价牛肉品质的重要指标,其形成受多种因素如营养、基因等的调控。微小RNA(miRNAs)是一类新发现的非编码小RNA,研究发现其对动物脂肪形成有重要的调控作用。但目前有关miRNAs在牛肉质调控领域尚属空白。因此,本研究拟采用miRNAs表达谱芯片、stem-loop qRT-PCR结合生物信息学等技术筛选、鉴定肉牛肌内脂肪特异性表达的miRNAs。以已获得的肉牛肌内前体脂肪细胞为实验材料,通过miRNAs基因沉默技术抑制筛选的miRNAs在肉牛肌内前体脂肪细胞中的表达,应用细胞化学染色、荧光定量-PCR、Western blot、Nothern blot等方法分别研究特异性miRNAs对肉牛肌内前体脂肪细胞分化的作用及调控的靶基因,初步探索miRNAs在肉牛肌内脂肪生长、发育过程中的作用及其调控机制,为进一步揭示肉牛不同部位脂肪沉积规律、改善肉质奠定理论基础。

结论摘要:

肌内脂肪含量是评价家畜肉品质的重要指标。本项目以牛为实验动物,从2010年起至2013年12月按项目研究计划圆满完成了项目涉及的研究内容,主要研究成果如下采集了牛(西门塔尔牛)皮下脂肪及第6-7根肋骨间的肌内脂肪组织,分别提取两种脂肪组织中的总RNA用于芯片实验;miRNA表达谱芯片杂交实验(经过生物素标记MiRNA、芯片杂交、芯片清洗染色、扫描等步骤后,采用Lowess*方法对芯片数据进行归一化,并基于归一化后数据进行t-Test和Cluster分析)筛选牛皮下脂肪和肌内脂肪差异表达的miRNA,同时考虑以下因素①p-value < 0.01;②样品两两比较的差异倍数建议 >= 4(即|log2| >= 2),至少 >2(即|log2|>1);③两样品中,较强的杂交信号值 >= 2000。结果在213个表达的miRNAs中发现了88个差异表达的miRNAs,其中有30个miRNAs在皮下脂肪和肌内脂肪中达到差异极显著水平(P<0.01);根据以上三个条件,对11个候选miRNAs进行 RT-qPCR验证。结果在11个候选差异表达的miRNA中,10个与芯片结果相一致,说明芯片结果可信度相对较高,而miRNA-143、miRNA-145、miRNA-140及miRNA-27b等在肌内脂肪中高表达;采用TargetScan软件对候选的miRNA进行靶基因预测,发现每个miRNA至少对应2个及以上靶基因,而这些靶基因基本都是与脂肪代谢、分化的基因;对目标miRNAs进行了GO和KEGG的富集性分析,显示目标miRNA的预测靶基因在MAPK、Wnt、Hedgehog、TGF-beta、GnRH等信号通路中显著富集,其中在MAPK信号通路中富集度最高。 采用“天花板”培养方法体外培养了牛肌内前体脂肪细胞,合成了候选miRNA-143的抑制剂,将其稳定转染至牛肌内前体脂肪细胞中,发现肌内前体脂肪细胞分化过程中miRNA-143表达量逐渐升高;抑制miRNA-143的表达,可以抑制肌内前体脂肪细胞分化及细胞内脂肪的积聚,脂肪分化关键基因C/EBPa及FABP-4的表达量减少,说明miRNA-143至少是通过C/EBPa及FABP-4来调节肌内脂肪的形成。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 7
  • 0
  • 0
  • 0
  • 0
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