真菌已经成为新化合物发现和现代药物创制的重要源泉,PKS和NRPS基因簇是目前真菌次级代谢产物研究的重点,Glarea lozoyensis产生的抗真菌药物卡泊芬净的前体物肺囊康定B0就是典型代表。基于合作者刘杏忠研究员实验室对G. lozoyensis的全基因组测序,发现一个可能与肺囊康定B0合成相关的基因簇,通过基因敲除确定两个合成关键基因。该基因组中含有5个PKS-NRPS,分析发现其中3个具有操纵子基本特征,这在真菌中未曾发现。本研究拟结合基因组结果,应用RACE、RT-PCR、基因敲除、LC-MS和NMR等系统研究G. lozoyensis中5个PKS-NRPS的结构、功能及其合成产物,通过基因敲除和产物分析明确肺囊康定B0的代谢途径。研究结果不仅为PKS和NRPS基因簇起源与进化研究提供新的依据和途径,同时为肺囊康定B0在今年国外专利到期后国内自主生产、产量提高提供材料和途径。
英文主题词Glarea lozoyensis;pneumocandin;polyketide synthase;nonribosomal peptide synthetase;operon