致力于发展新的计算生物学方法并运用于宏基因组分析,阐明极端微生物微进化过程和机制的若干关键问题。主要研究内容为以极端环境下的微生物群落为研究对象,基于当前高通量测序技术获得的宏基因组数据,围绕极端微生物基因组微进化的主题,发展和运用一系列的计算生物学新方法和新技术,首先预测、定位与极端环境相关的关键基因;在此基础上进行关键基因的功能注释,并定量刻画近缘物种之间及同一物种内的关键基因及其转录、翻译等调控机制的演化;进一步通过基因组比较、功能分类分析、代谢网络分析等手段,分析不同物种及其关键基因适应和影响极端环境的分子机制。课题的立项属于围绕本计划第二个重点支持方向的计算生物学新方法研究,并提出了明确的技术路线和解决方案。
英文主题词extremophiles;microbes;metagenomes;computational biology methods;