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林木高质量遗传图谱构建和QTL精确定位统计方法及应用
  • 项目名称:林木高质量遗传图谱构建和QTL精确定位统计方法及应用
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:30872051
  • 申请代码:C161003
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2009-01-01-2011-12-31
  • 项目负责人:童春发
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:南京林业大学
  • 批准年度:2008
中文摘要:

林木具有复杂的生物学特性,其遗传连锁图谱构建和数量性状基因座(QTL)定位的统计分析方法一直没有得到很好的发展。本研究利用林木F1代群体以及不同种类的分子标记,建立了多位点连锁分析的统计模型,使得1:1、1:2:1、1:1:1:1和3:1等分离比的标记位点能同时进行连锁分析;以多位点连锁分析的似然函数值作为目标函数对连锁群中的分子标记排序,可以获得高质量的林木遗传图谱。基于使用各种分离比的分子标记构建的林木遗传连锁图谱,建立了林木QTL区间作图和功能作图统计分析模型,模型考虑了三种QTL分离类型,并以模型选择指数AIC和BIC推断最大可能的QTL分离类型。使用VC++ 6.0编写了林木遗传连锁图谱构建的作图软件FsLinkagMap 2.0、林木QTL区间作图软件FsQtlMap 1.0以及林木QTL功能作图软件3FunMap 1.0,供林木遗传育种学家自由使用。最后,重新构建了美洲黑杨×欧美杨的遗传连锁图谱,并对杨树的生根性状进行了QTL分析,发现了3个控制杨树生根性状发育轨迹的QTL。本项目研究成果有助于构建林木高密度遗传连锁图和QTL的精确定位。

结论摘要:

英文主题词Forest trees; Genetic linkage map; Quantitative trait locus; Statistical model; Populus


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