中文摘要：

生态系统中不同的生物类群各自具有其特有的生态功能，而如何有效地表征生物多样性并进而分析其与环境的相互关系是阐述各类群生态功能的关键。本项目选择原生动物中多样性丰富、进化地位相对较高、且广泛分布于各类水体的下毛类纤毛虫为研究对象，通过设计下毛类纤毛虫特异性引物来分析其rRNA基因多样性，建立针对特定类群的DNA指纹分析方法，并以此来研究淡水生态系统下毛类纤毛虫的多样性及其在生态学研究中的应用。在对不同时空范围、不同环境下毛类纤毛虫进行比较研究的基础上，揭示不同类型淡水水体下毛类纤毛虫的DNA指纹结构特征及其时空变化规律，进而分析其指纹结构与物种组成对应关系及其对环境变化的响应和调节机制。以期利用微观的方法手段来探讨和阐述目标生物类群各组成成分之间的相互影响及其与环境相互作用的生态规律，为特定类群生态功能的分子阐释和水环境特定污染物的预警提供科学依据和积累基础资料。

结论摘要：

生态系统中不同生物类群具有各自特有的生态功能以维持生态系统的稳定。如何有效地揭示其多样性及其时空变化规律，进而分析其与环境的相互关系，以及它们在生物地球化学循环中的作用是认识各类群生态功能的关键。本课题选择原生动物中多样性丰富、进化地位相对较高、且广泛分布于各类水体的下毛类纤毛虫为主要研究对象，通过设计下毛类纤毛虫特异性引物分析了其rRNA基因多样性，建立针对特定类群的DNA指纹分析方法。在此基础上，采用所设计的下毛类纤毛虫特异性引物及建立的方法对长江口不同环境的下毛类纤毛虫进行了研究。结果表明，两对引物均能很好地揭示特定类群——下毛类纤毛虫的多样性，进一步的CCA分析表明长江口下毛类纤毛虫的分布主要受盐度的影响。此外，本课题还探讨了针对原生动物进行高通量测序和针对特定原生动物类群的进行生物量测定的可行性，为相关生态学研究提供了参考。已发表标注该课题资助论文7篇，其中SCI论文4篇（JCR前15%论文1篇），另有已投稿论文1篇。