玉米高赖氨酸育种是品质育种重要研究领域,主要以o2突变为种质。新种质缺乏是其发展瓶颈。而且,o2玉米籽粒赖氨酸(Lys)含量仅为0.4%左右,不能满足人畜禽需求,为其提供了发展空间。用自育新突变奥帕克-16(o16)与o2突变基因聚合的分子标记辅助选择,表明可提高Lys含量。但o16基因的序列、结构及其对胚乳质地和Lys含量的调控等科学问题则未知。本研究拟以o16和o2突变体及其近等基因系以及普通玉米为试材,用Mu Illumina法结合分子生物信息学分析分离克隆o16基因,用基因专化PCR、遗传作图、RT-PCR等进行共分离和表达鉴定,用RT-PCR扫描技术获取全长cDNA,用RNAi技术进行功能鉴定分析,以期认识o16基因的核苷酸序列、基因结构及其对玉米籽粒胚乳质地和Lys含量的调控。这对o16突变调控玉米籽粒胚乳质地和Lys含量的机理研究和寻找高Lys分子育种新方法有科学和实践意义。
opaque-16;Mu-Illumina;SLAF-seq;RT-qPCR;Label-free quantitation
普通玉米籽粒缺乏赖氨酸,营养价值较低;而高赖氨酸玉米籽粒赖氨酸含量高,营养价值较高。玉米奥帕克-16(opaque-16,o16)突变是Mu转座子插入诱导的突变,籽粒赖氨酸含量高。将它与opaque-2(o2)、waxy(wx)基因聚合后,可较大幅度提高玉米籽粒赖氨酸含量。本研究以o16突变、F2群体和近等基因系(NILs)等为材料,进行了NILs的继续选育、o16突变系的Mu Illumina测序、F2群体简化基因组测序(SLAF-seq)、o16突变NIL的Mu Illumina测序、候选基因专化PCR、候选基因RT-qPCR以及o2和o16突变NIL非标记定量蛋白质组(LC-MS/MS-based labelfree quantitative proteomics)等研究。取得如下主要结果(1)在具有不透明籽粒表型的NILs中,o16系的赖氨酸含量与o2系的相当或高于o2系的。(2)QCL3021-5和QCL3024-4两个o16突变系共有Mu插入基因数137个,主要分布在Chr1、Chr4、Chr2、Chr3和Chr9上。(3)从SLAF标签中,筛选出6个候选区域,涉及174个基因,其中144个在Chr5上,30个在Chr2上。(4)Mu在4个NILs中插入的独有基因数和交叠基因数共有64个,分布在玉米的十条染色体上,以Chr8上分布最多。(5)上述3次测序对候选基因的分析结果,基本上没有相同的。(6)对NILs中的27个Mu插入候选基因(除独有基因外)进行RT-qPCR,结果表明11个基因的表达与赖氨酸含量显著相关,其中4个基因位于Chr8上。(7)非标记定量蛋白质组的结果表明,在o2系和o16系间有16组蛋白有显著性差异;o2系中有76组蛋白在o16系中没有,o16系中有51组蛋白在o2系中没有。上述结果,对o16突变特定候选基因的筛选以及o16突变及其高赖氨酸形成的机理研究奠定了基础。