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玉米奥帕克-16(o16)突变基因的分离克隆与鉴定
  • 项目名称:玉米奥帕克-16(o16)突变基因的分离克隆与鉴定
  • 项目类别:地区科学基金项目
  • 批准号:31160307
  • 申请代码:C1306
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2012-01-01-2015-12-31
  • 项目负责人:杨文鹏
  • 负责人职称:研究员
  • 依托单位:贵州省农业科学院
  • 批准年度:2011
中文摘要:

玉米高赖氨酸育种是品质育种重要研究领域,主要以o2突变为种质。新种质缺乏是其发展瓶颈。而且,o2玉米籽粒赖氨酸(Lys)含量仅为0.4%左右,不能满足人畜禽需求,为其提供了发展空间。用自育新突变奥帕克-16(o16)与o2突变基因聚合的分子标记辅助选择,表明可提高Lys含量。但o16基因的序列、结构及其对胚乳质地和Lys含量的调控等科学问题则未知。本研究拟以o16和o2突变体及其近等基因系以及普通玉米为试材,用Mu Illumina法结合分子生物信息学分析分离克隆o16基因,用基因专化PCR、遗传作图、RT-PCR等进行共分离和表达鉴定,用RT-PCR扫描技术获取全长cDNA,用RNAi技术进行功能鉴定分析,以期认识o16基因的核苷酸序列、基因结构及其对玉米籽粒胚乳质地和Lys含量的调控。这对o16突变调控玉米籽粒胚乳质地和Lys含量的机理研究和寻找高Lys分子育种新方法有科学和实践意义。

结论摘要:

普通玉米籽粒缺乏赖氨酸,营养价值较低;而高赖氨酸玉米籽粒赖氨酸含量高,营养价值较高。玉米奥帕克-16(opaque-16,o16)突变是Mu转座子插入诱导的突变,籽粒赖氨酸含量高。将它与opaque-2(o2)、waxy(wx)基因聚合后,可较大幅度提高玉米籽粒赖氨酸含量。本研究以o16突变、F2群体和近等基因系(NILs)等为材料,进行了NILs的继续选育、o16突变系的Mu Illumina测序、F2群体简化基因组测序(SLAF-seq)、o16突变NIL的Mu Illumina测序、候选基因专化PCR、候选基因RT-qPCR以及o2和o16突变NIL非标记定量蛋白质组(LC-MS/MS-based labelfree quantitative proteomics)等研究。取得如下主要结果(1)在具有不透明籽粒表型的NILs中,o16系的赖氨酸含量与o2系的相当或高于o2系的。(2)QCL3021-5和QCL3024-4两个o16突变系共有Mu插入基因数137个,主要分布在Chr1、Chr4、Chr2、Chr3和Chr9上。(3)从SLAF标签中,筛选出6个候选区域,涉及174个基因,其中144个在Chr5上,30个在Chr2上。(4)Mu在4个NILs中插入的独有基因数和交叠基因数共有64个,分布在玉米的十条染色体上,以Chr8上分布最多。(5)上述3次测序对候选基因的分析结果,基本上没有相同的。(6)对NILs中的27个Mu插入候选基因(除独有基因外)进行RT-qPCR,结果表明11个基因的表达与赖氨酸含量显著相关,其中4个基因位于Chr8上。(7)非标记定量蛋白质组的结果表明,在o2系和o16系间有16组蛋白有显著性差异;o2系中有76组蛋白在o16系中没有,o16系中有51组蛋白在o2系中没有。上述结果,对o16突变特定候选基因的筛选以及o16突变及其高赖氨酸形成的机理研究奠定了基础。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 3
  • 0
  • 0
  • 2
  • 0
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