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百菌清水解脱氯酶Chd的催化机制研究及酶的改造
  • 项目名称:百菌清水解脱氯酶Chd的催化机制研究及酶的改造
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:31070100
  • 申请代码:C010501
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2011-01-01-2013-12-31
  • 项目负责人:蒋建东
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:南京农业大学
  • 批准年度:2010
中文摘要:

微生物编码的脱氯酶在氯代芳香族化合物的脱毒、降解方面起着关键作用,是当先国际研究的热点。氯代芳香族化合物的脱氯方式主要有还原、巯基取代、氧化和水解,而关于水解脱氯酶的脱氯机制只有4-氯苯甲酸脱氯酶的报道,该酶系统需要3个独立酶的共同作用,且需要CoA和ATP。本项目将在分离筛选到的15株氯代芳香族杀菌剂百菌清降解菌株和一个全新的、不依赖CoA和ATP的百菌清水解脱氯酶Chd的基础之上,研究不同百菌清降解菌株中水解脱氯酶的差异性,明确影响Chd活性的关键氨基酸位点;研究Chd的催化核心区域、单核还是双核锌离子中心、金属离子的替代性和金属配基结合位点;对Chd进行理性设计和随机改造,获得催化活力增强或底物范围增加的突变体酶,为氯代芳香族化合物的微生物降解提供理论指导和优良材料,具有十分重要的意义。

结论摘要:

16株多样的百菌清降解菌株中百菌清水解脱氯酶基因chd高度保守(同源性为99%以上),来源于8个不同属的代表菌株中chd基因和一个新的插入序列ISOcsp1紧密关联,整个片段高度保守,而且chd基因的启动子位于ISOcsp1的IRR中,显示chd基因的广泛分布是水平转移的结果。毒性抑制实验表明chd基因的水平转移的生态学意义是将百菌清转化为毒性较小的4-羟基百菌清,有助于微生物群落快速适应高浓度百菌清污染环境。 研究发现Chd的氨基端的15个氨基酸对Chd的催化活性没有影响,但16-50位的氨基酸对于Chd的构象或功能是必需的。定点突变实验表明H128,H157,D45,D130,D184,W241,S126和G208为Chd催化活性所必需。 利用电感耦合离子发散光谱仪证明Chd的金属中心是一个双锌(Zn2+-Zn2+)结构。结合定点突变,确定了金属结合位点是H128、H131、N230、D130和H271。利用螯合透析,再混合温育的实验方法,发现Zn2+, Co2+, Cd2+, Mn2+能不同程度恢复脱金属辅基酶(apo-Chd)脱氯活性。重组Zn2+-Chd的酶活力与天然酶活力相当;Co2+-Chd的酶活比Zn2+-Chd的酶活提高了20%;而Cd2+-Chd和Mn2+-Chd的酶活比Zn2+-Chd酶活都有下降,分别为原来的91.6%和57%。 通过易错PCR方法,获得了4个活力提高的Chd突变体,发现总共有7个氨基酸位点发生了突变, 突变体TB-1的比酶活提高了2.5倍。将活力提高的突变子用DNA shuffling的方法进行片段重组,获得突变体TB-5,其比酶活提高了3.7倍。测序结果显示有3个氨基酸位点发生了突变,分别是Q146R、N168Y和S303G。 通过项目研究,共发表SCI 论文10篇;申请国家发明专利2项;培养博士、硕士研究生5名。 项目累计拨入经费35万元,支出35万元,项目收支平衡,经费使用合理。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 14
  • 0
  • 0
  • 0
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