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人类复杂疾病基因表达谱特征基因识别技术
  • 项目名称：人类复杂疾病基因表达谱特征基因识别技术
  • 项目类别：面上项目
  • 批准号：30370798
  • 申请代码：H1813
  • 项目来源：国家自然科学基金
  • 研究期限：2004-01-01-2006-12-31
  • 项目负责人：李霞
  • 负责人职称：教授
  • 依托单位：哈尔滨医科大学
  • 批准年度：2003
中文摘要：

后基因组计划最大的挑战之一是寻找复杂疾病的相关基因，并进行基因功能鉴定。本项目针对高通量基因表达谱数据的高维、高噪、高相关（冗余）与有限样本等特点，致力于研究复杂疾病的特征基因识别及其特征基因相关网络建立的新方法与新技术。并结合GeneOntology和KEGG代谢通路等各种功能分子生物学数据库的信息资源，预测并解释复杂疾病相关特征基因的功能及特征基因网络互作关系。并将新方法与新技术应用于信息资源

中文主题词： 复杂疾病；基因表达谱；特征基因; 数据挖掘；识别技术
英文摘要：

complex disease；gene recogniti

英文主题词： complex disease；gene recogniti
结论摘要：

项目按原计划进行，我们建立了"特征基因"与"疾病类别"和目标靶基因的概念。基于基因表达谱高维数据，我们系统研究特征基因数据挖掘算法与分析策略，提出基于决策树特征基因识别的EFST及特征基因和基因表达谱模式识别分析结果稳定性的评价测度，根据特征基因识别EFST方法识别的不同特征基因群，定义特征基因的关联强度，构建特征基因相关网络和时间延迟调控网络TDGRN模型，并应用于结肠癌、白血病等疾病的基因表达谱数据，识别结肠癌、白血病等疾病的相关基因。研究基于基因表达多基因挖掘方法，研究特征基因在网络中的互作模式关系及生物学意义和基因网络核心结构团的挖掘技术，完成基因表达谱特征基因挖掘技术和基因网络重建的分析系统，并研究了周期性表达基因之间的表达相关性，并扩展研究工作到研究疾病靶蛋白、靶通路的模式识别生物信息学方法。主要成果发表在国内外著名生命科学杂志《Nucleic Acids Research》(2006年影响因子7.26)、《Genomics》、《中国科学》等上，项目研究期间共发表科研论文47篇，完成期刊论文34篇，会议论论文13篇，其中SCI收论文28篇，累计SCI IF 45.61。

成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 52
  • 14
  • 0
  • 0
  • 0
期刊论文
An Analysis of Gene Expression
A Novel Ensemble Decision Tree
A Novel Feature Ensemble Techn
时间延迟基因调控网络重构的决策
Application of a Genetic Algor
基于决策森林特征基因的两种识别
Analysis of Sib-Pair IBD Profi
An ensemble method for gene di
利用亚细胞位置特异的基因功能模
心血管疾病遗传连锁分析及发病风
A robust hybrid between geneti
A New Method for Gene Function
A novel model-free approach fo
G Protein Binding Sites Analys
A Novel Method for Expanding C
应用DNA芯片数据挖掘复杂疾病相
A Novel Visualization Classifi
Large-Scale Ensemble Decision
Association Research on Potass
Novel Strategies to Identify R
特征基因挖掘的决策森林方法
一种基于递归分类树的集成特征基
决策树特征基因选择方法对SVM有
Discovery of Time-Delayed Gene
Gene mining: a novel and power
根据基因功能表达谱研究抑郁症模型及安佳欣胶囊的抗抑郁症机制
结合蛋白质互作与功能类的可分性预测蛋白质功能
同胞对间全基因组表达差异与SNP位点血缘一致性相关分析
同一代谢通路上基因表达相关性分析
利用基因芯片观察抑郁症大鼠模型基因表达的变化
人类蛋白质互作网络hub蛋白与其结构域关联分析
复杂疾病靶基因识别与网络重建的计算系统生物研究
microRNA层面上癌症的公共机制
利用亚细胞位置特异的基因功能模块与表达调控网络识别疾病特征基因
基于功能模块的基因表达谱聚类分析
基于Agent和数据切片的分布式神经网络协同学习研究
cDNA芯片缺失值处理对基于基因表达谱的疾病分类的影响
基于耦合双向聚类技术的DLBCL异质性分析
离子通道亚型与其基因共表达的关联研究
安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达影响的初步研究
决策森林分析大型IBD谱定位酒精依赖症相关基因
Identifying disease feature genes based on cellular localized gene functional modules and regulation networks
基于IBD谱和基因组结构的复杂疾病相关分子标记识别的新策略
Role of coxsackievirus and adenovirus receptor in the pathogenesis of dilated cardiomyopathy and its influencing factor
会议论文
Improvement in SNP Mapping of
Identifying the function modul
Genetic Mining of the Relevant
A Genetic Algorithm — Support
Decision forest analysis of la
An integrative genome-wide str
SNP to Expression: Identifying
Feature Gene Selection Based o
Familial aggregation analysis
Classification of Cancer Types
Combined Expression Pattern of
Gene Interaction Assay Based o
Reverse Engineering of Multipl
Reconstuct Gene Regulatory Sub
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