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用于评估肺鳞状细胞癌预后的分子细胞遗传学标志和基因筛选研究
  • 项目名称:用于评估肺鳞状细胞癌预后的分子细胞遗传学标志和基因筛选研究
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:81272414
  • 申请代码:H1606
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2013-01-01-2013-12-31
  • 项目负责人:林冬梅
  • 负责人职称:主任医师
  • 依托单位:中国医学科学院
  • 批准年度:2012
中文摘要:

目前对肺癌患者预后评价仍然依据临床分期,但即使相同临床分期的患者也会存在生存状况的差别,至今尚无有效预测肺癌患者预后的分子细胞遗传学标志。在前期工作中我们利用aCGH技术针对肺鳞状细胞癌高危(<2年内死亡)和低危(>5年生存)病例肿瘤组织分析结果显示,41个染色体片段可以将高、低危患者区分开来,并且以3p21.31、4q35.1的缺失以及5p13.2、14q32.33、19p13.11的扩增改变尤为显著,并从中筛选出这五个片段所涵盖的13个基因。本课题将在此基础上采用遗传学改变分辨精确度更高的Affymetrix SNP 6.0芯片技术,在独立大样本中对肺鳞癌组织进行全基因组拷贝数及Array-CGH所不能提示的杂合性缺失等进行分析,并重点对前期结果进行验证,试图筛选出一组有鉴别意义的扩增(或缺失)基因作为评估肺鳞癌预后的分子标志,为后续基因相关功能研究、临床预警预后和指导治疗提供依据。

结论摘要:

目前对肺癌患者预后评价仍然依据临床分期,但即使相同临床分期的患者也会存在生存状况的差别,至今尚无有效预测肺癌患者预后的分子细胞遗传学标志。前期工作aCGH技术针对肺鳞状细胞癌高危(<2年内死亡)和低危(>5年生存)病例肿瘤组织分析结果可以将高、低危患者区分开来,并且以3p21.31、4q35.1的缺失以及5p13.2、14q32.33、19p13.11的扩增改变尤为显著,并从中筛选出这五个片段所涵盖的13个基因。本课题将在此基础上采用遗传学改变分辨精确度更高的Affymetrix SNP 6.0芯片分析技术,在独立样本中进一步探索进行全基因组拷贝数变化分析及Array-CGH所不能提示的杂合性缺失(LOH)分析,并重点对上述5条染色体3p、4q、5p、14q、和19p遗传学改变及相关基因进行验证。初步探索性研究结果显示SNP芯片技术在LOH层面难以达到分组病例共性特点的筛选研究目的,在一定程度上为相关后续研究提供了可供参考的信息。对于所前期结果所筛选出的十几个基因RT-PCR验证结果则显示SLC1A3基因与预后因素相关,后续可考虑选择FISH方法进一步筛选基因验证。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 2
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