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淡水中PP噬藻体的时空分布与遗传多样性
  • 项目名称:淡水中PP噬藻体的时空分布与遗传多样性
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:30370062
  • 申请代码:C010804
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2004-01-01-2006-12-31
  • 项目负责人:赵以军
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:华中师范大学
  • 批准年度:2003
中文摘要:

PP-WH1基因文库构建和基因组全序列测定;分析PP-WH1重要基因功能和保守序列;对PP-WH1基因组中阅读框进行解析,对照核酸数据库探讨其种系发生;基于保守序列设计PCR引物并结合酶切图谱分析,分析PP噬藻体遗传多样性和分子进化关系;研究PP噬藻体感染对宿主形态和生理的影响及作用机理;在不同季节与地点开展系统调查,分析各种环境因子与PP噬藻体的时空分布与动态变化的关系;摸索宿主密度与PP噬藻体浓度二者之间变化的规律,找出可能存在的使噬藻体大量增殖的宿主密度的临界水平。目前国外认识到噬藻体在海洋环境中的重要生态意义,因此开始重视海洋噬藻体的研究并取得了突破性进展,而淡水噬藻体的生态学还是未知研究领域。PP噬藻体是我国淡水中的典型噬藻体,其分布、丰度和遗传多样性对了解噬藻体在淡水中的行为和作用,认识生态功能是十分重要的。

结论摘要:

研究了日光中UV-B和其它因素对噬藻体PP的失活及宿主对光失活噬藻体的修复能力;调查了环境中噬藻体PP类噬藻体的遗传多样性;分析了噬藻体PP的基因组;通过对噬藻体PP感染野生宿主藻的吸附率和一步生长曲线的研究,建立了噬藻体PP效价日波动的动力学模型。研究表明噬藻体PP能够迅速裂解环境中的宿主藻,释放量较大;日光中UV-B为主的多种因素能使噬藻体PP迅速失活,宿主能够有限度的快速光修复光损伤的噬藻体,修复水平取决于损伤的程度。噬藻体PP效价日波动数学模型反映出噬藻体PP的增殖较为迅速,但其在环境中的失活也很快,因此活性噬藻体PP的效价发生明显波动;噬藻体PP在光照(白天)和黑暗(夜晚)条件下的增殖能力和失活率不同。噬藻体PP类噬藻体的遗传多样性较为稳定,其与宿主的数量关系既是噬藻体PP种群维持的原因,也是噬藻体PP发挥生态功能的基础。 噬藻体PP的基因组大小约为40k bp,153个序列与细菌的序列有一定相似性,有120个序列与病毒序列具有一定的相似性,还有5个片段是与任何已知序列都不相似。噬藻体PP的DNA序列可能明显不同于以往所公布的噬菌(藻)体的序列。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 5
  • 3
  • 0
  • 0
  • 0
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