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VNTR技术用于中国结核分支杆菌基因分型的研究
  • 项目名称:VNTR技术用于中国结核分支杆菌基因分型的研究
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:30471526
  • 申请代码:H1901
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2005-01-01-2007-12-31
  • 项目负责人:万康林
  • 负责人职称:研究员
  • 依托单位:中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
  • 批准年度:2004
中文摘要:

结核菌菌株分型对结核病流行病学调查和监测、传染源的发现以及发病机制的研究都极为重要。随着分子生物学理论和技术的飞速发展,诸多高度特异的基因分型方法得到研究建立,如限制性片段长度多态性、DNA指纹图谱分析、脉冲场凝胶电泳、PCR酶切分型、随机扩增DNA多态性、DNA序列分析以及基因芯片技术等。尤其是随着全基因组序列的明了,促进了操作简便、快速、分辨力强、结果稳定性和重复性好,而且易于分析和比较的新方法- - VNTR分型方法的发展和完善。但该方面的研究国内尚未见报道。因此,本项目拟采用VNTR技术对中国结核分枝杆菌进行基因分型研究,结合BioNumerics(Version 3.0)数据库软件建立我国结核分枝杆菌数字化基因信息库。为新分离菌株进行快速鉴定、从病原学上监测结核病流行趋势和动态、追溯传染源和确定暴发流行提供快速、有效的方法,对有效防治结核病、保护人民健康具有重要的意义。

结论摘要:

本项目旨在建立用于中国结核分支杆菌基因分型的标准化多位点VNTR技术。在16个省、市、自治区收集到5000余株结核分枝杆菌和100多株非结核分枝杆菌及其相应的病例背景资料,进行了有效的传代培养和保藏,在国内首次建立了规范化的菌株资源库。确定了MLVA中的15个VNTR位点,建立了MLVA标准方法和操作程序。在对结核分枝杆菌的株水平鉴定上,MLVA高于Spoligotyping,对于IS6110 5拷贝以下的菌株,MLVA高于IS6110-RFLP。MLVA可有效地进行结核病的流行病学调查和病原学监测。通过对中国12 个省、市、自治区的2018株结核分枝杆菌的基因多态性研究,结合BioNumerics(Version 5.0)数据库软件,建立图像分析数据库和结核分枝杆菌的数字化基因信息库。在国内首次证实示中国结核分枝杆菌存在明显的基因多态性,主要流行的基因型有Beijing family、China2 和China3等。首次在新疆发现的CAS基因型和广西发现的古典型将具有重要的流行病学意义。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 14
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